六安市疾病预防控制中心是政府举办的疾病预防控制和公共卫生技术管理服务的公益性事业单位，于2003年在原六安市卫生防疫站的基础上经过疾病预防控制和卫生监督体制改革成立的。2014年，经市编委批准加挂六安市健康教育所。中心依法承担疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与控制、实验室检测分析与评价、健康教育与健康促进、技术指导与应用研究等公共职能。是安徽医科大学、蚌埠医学院及皖南医学院本科生实习教学基地，以及安徽医科大学公共卫生硕士（MPH）联合培养基地。
中心位于皋城中路，占地26.6亩，建成面积约11919.8平方米，在建面积4795平方米，合计建筑面积16714.8余平方米。中心编制112人，聘用员额20人，现有在职职工110人，其中研究生学历9人，本科学历82人（在职MPH12人）；中级职称32人、高级职称17人（其中正高5人）。拥有享受政府特殊津贴的专家、市级学术带头人及拔尖人才，省预防医学会、医学会多个专委会的委员等一批高精尖专业人才。设有急性传染病防制（卫生应急办公室）、免疫预防、慢性非传染性疾病防制（基本公共卫生服务管理）、地方病/寄生虫病与病媒生物防制（中心创建卫生城市办公室）、性病艾滋病防治、结核病防治、公共卫生、职业病防治、健康教育、预防性健康体检（预防医学门诊）以及检验等18个科室。中心开展疾病预防控制领域的科学研究。《麦氏弧菌非O1群霍乱弧菌在水源水中的分布规律》的科研成果荣获省科技进步二等奖、市科技进步一等奖;《致泻大肠埃希菌在水源水中的分布规律与腹泻病关系的研究》获六安市科技成果一等奖，《手足口病的病原学研究及其分子流行病学分析》通过六安市科技成果鉴定，三项研究成果均达到国内领先水平。目前正在承担省卫健委科研项目5项，与中国疾控中心病毒所及传染病防制所合作各一项，与医学院校合作科研项目2项，自主科研项目3项。近三年在核心期刊发表学术论文28篇，SCI论文4篇。

中心实验室面积4000平方米。建有P2负压、1000级净化（局部100级）、艾滋病确证、流感网络监测、麻疹监测、碘盐及尿碘定量检测和结核病参比等专业实验室。拥有了液质联用仪（LC-MSMS）、电感耦合等离子体质谱仪（ICP-MS）、微生物鉴定仪、脉冲场凝胶电泳仪、PCR扩增仪等高新专业检测设备，卫生检测能力位于全省前列。

质量管理体系持续有效运行，积极探索先进的管理模式，引进了ISO9000、CMA、CNAS等质量管理系统。同时，加强信息化建设，业务管理、现代化办公实现信息管理，如世纪科怡档案管理、上网行为管理、OA协同办公系统以及工作数据统一采集平台等，确保了各项工作规范有序运行。中心还致力实验室能力拓展及职业卫生现场监测和卫生学评价能力建设，先后获得“食品检验机构资质认定”、“建设项目职业病危害因素评价（乙级）资质”、“放射防护检测评价（乙级）资质”等。

中心始终坚持“拼搏、奉献、求实、创新”的职业精神，严格履行职责，着力于现代疾控的建设模式，积极适应医学模式和疾病谱的变化，适应社会、经济建设新形势需要，不断完善疾病防控新体系、新机制，提升服务能力和服务水平，致力于为皖西580万群众营造一个健康、和谐的发展环境，满足广大市民的多层次健康需求。