医院设院本部、东院区等三个院区，下辖13家分院和9个卫生服务站，一共近2000张床位。年门诊量100万人次以上，年出院病人4万人次以上。其中，本部和东院区共计床位1320张，设有51个临床科室、10个医技科室；中医科为全国综合医院中医药工作示范单位、山东中医药大学硕士研究生培养基地；普外科、骨科、放化疗科、心内科、消化内科、神经内科、检验科、中医科、急诊科、感染疾病科、烧伤整形科等11个专业是济宁市重点专科（专业），相继成立国际会诊中心、胸痛中心、卒中中心、肿瘤中心，学科建设稳步提升。 医院拥有德国西门子3.0T核磁共振成像系统、美国通用宝石能谱CT、西门子大型数字减影血管造影机、西门子多排螺旋CT、多座高压氧舱、电子直线加速器、全自动分析生化仪等万元以上医疗设备1500余台（件）。医院同北京阜外医院、北京大学人民医院、北京大学人民医院、上海中山医院、山东大学齐鲁医院、台湾长庚医院、新西兰国立奥塔哥大学威灵顿医学院等多家国内外先进医疗机构长期建立友好协作关系。先后荣获全国百家“三好一满意”示范医院、全国十佳企业医院、全国诚信示范医院、山东省省管企业文明单位等荣誉称号，护理团队被评为“全国南丁格尔志愿服务队”，全年患者综合满意度保持96％以上。 2018年，新里程医院集团控股投资医院，医院改革重组更名为兖矿新里程总医院，并成为事业法人单位。新里程医院集团是国内大的综合医院集团之一，以医院为产业入口，业务涵盖综合医院运营、基层医疗、互联网医疗、跨境医疗、养老服务、供应链中心、放疗中心等业务，控股管理床位数超过一万张。