吉安慈济二医院创建于1973年，是吉安市区城南一所集医疗、急救、预防保健、医疗康复、医疗教学、科研为一体的现代化综合性非营利性医院，医院占地面21亩，建筑面28500平方米，编制床位300张，现有医务人员250余人，其中教授、主任医师10余人，副主任医师30余人，中级专业技术人员100余人。
媒体关注--创科研诊疗航标 自建立以来，医院多项科研成果达到国际标准，被国内外权威媒体广泛报道，成为研诊疗新航标。
一、科室设置齐全 医院设有呼吸内科，消化内科，心血管内科，神经内科，肿瘤科，肾内科，内分泌科，血液内科，传染病科，小儿科、疼痛科、泌尿外科、手足显微外科、妇产科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮肤科、整形外科、急诊科、中医科、中医骨伤科、康复医学科、肛肠科、感染科、麻醉科、肝病科、结石科等26个临床科室。以及放射科、ct室、功能检查科、检验科、病理科、超声影像科等8个医技科室。职能科室14个。 职能科室有：院办公室、医务科教科、护理部、防保科、财务科、收费科、总务科、保卫科等。
二、医疗设备高精尖 医院近些年投入大量资金，先后添置了各种进口、国产先进设备。如（DR）、螺旋CT、彩超、腹腔镜、肾镜、输尿管镜、膀胱镜、鼻内窥镜、前列腺电切镜、椎间盘后路镜、钬激光、碎石机、全电脑肛肠治疗仪、不孕不育治疗仪、利普刀设备、介入导融电解治疗系统、各种激光治疗设备等200多台（套）。
三、技术力量扎实、雄厚 医院现有专业技术人员210人，其中主任医师、副主任医师等职称人员35人，中级职称人员60人。 各科除能完成常见病、多发病诊疗技术外，医院特色学科、特色技术鲜明。 （一）腔镜微创手术技术 普外科开展腹腔镜下胆囊摘除术、保胆取石术。 泌外科开展经皮肾镜钬激光碎石术、输尿管镜钬激光碎石术、前列腺电切术。 妇科开展宫腔镜、腹腔镜各种微创手术。 （二）疼痛科诊疗技术已达省内先进水平 疼痛科已开展颈腰椎盘切吸术、颈腰椎间盘突出射频靶点热凝术、臭氧消融术、激光、等离子、胶原酶溶解等各类介入治疗。 腰椎间盘后路镜下髓核摘除术、椎体成形术、膝关节镜下半月板修复、游离物取出等手术。 （三）显微外科已开展断肢、断指（趾）再植术 （四）皮肤科诊疗技术达吉安市水平 吉安市皮肤病防治所设在我院，皮肤科开展皮肤内科、皮肤外科、皮肤美容等多种皮肤疾病的诊治。
四、医疗用房医院新投入使用的住院大楼按宾馆式要求建设，病区配置了空调、彩电、吸引、中心供氧、传呼、独立卫生间等设施。就医环境、住院条件大大改善。 医院实行24小时开诊，节假日不休息，吉安市120急救电话设在医院。医院是各县市区医保、农保定点单位。 医院的服务宗旨是“以病人为中心，全心全意为病人服务，将充满人性的关爱奉献给每一位患者”。
发展历程
1973年于美丽的赣江之滨吉安市中心城区挂牌成立吉安市第二人民医院。
1974年吉安市人民皮肤病防治门诊部更名为吉安市皮肤病防治所隶属于吉安市第二人民医院。
2007年6月15日古南街道社区卫生服务中心成立，隶属于吉安市第二人民医院。
2010年6月24日我院组成“抗洪救灾医疗小分队”赶赴灾区进行巡回医疗、防病治病、健康宣教。
2010年疼痛医学科成立，医院添置了C臂X光机、椎间盘镜等各种高精尖设备。
2011年9月10日住院大楼开工2013年6月25日竣工完毕。
2013年8月1日成立中医传统与现代康复相结合的康复医学科。。
2015年口腔科分离五官科，正式成为独立科室。
2017年8月16日医学美容科成立。开展整形美容、皮肤美容、无创注射、植发等四大诊疗项目。
2017年8月16日医学美容科成立。开展整形美容、皮肤美容、无创注射、植发等四大诊疗项目。
2021年设立吉安市吉州区吉安第二医院新冠疫苗接种点。
