北京大学肿瘤医院云南医院云南省肿瘤医院昆明医科大学第三附属医院是云南省集医疗、教学、科研、预防于一体的三级甲等肿瘤专科医院，于2021年获批国家肿瘤区域医疗中心建设项目，承担着区域内肿瘤防治研究、人才培养及肿瘤学术交流任务，是云南省癌症中心、云南省肿瘤诊疗质量控制中心、云南省肿瘤临床医学中心、云南省恶性肿瘤临床医学研究中心、云南省肿瘤分子基因中心、云南省临床药学中心、云南省核医学专业医疗质量控制中心、分子肿瘤学国家重点实验室云南省肿瘤医院转化医学中心、云南省肿瘤精准诊疗工程研究中心、云南省肺结节-肺癌一体化诊治中心及云南区域性高发肺癌研究协同创新中心，是国家卫生健康委肺癌、食管癌、大肠癌等肿瘤早诊早治基地，云南省肿瘤继续教育基地，云南省肺癌国际合作示范基地，国家药物临床试验（肿瘤学）机构，具备干细胞临床研究备案机构资质。有5个重点实验室，8个省级创新团队，12个研究中心，9个专业开展住院医师协调培养，2个院士工作站、8个专家工作站，是昆明医科大学第三附属医院博士后科研工作站。作为昆明医科大学的直属附属医院，有10个教研室，博士生导师33人、硕士生导师197人，形成了本、硕、博、继续医学教育、留学生培养的人才培养体系。
医院已建立起以国家临床重点专科（肿瘤科、胸外科、胃肠外科）为依托，胸外科（胸部肿瘤）、耳鼻喉头颈外科（头颈肿瘤）、口腔颌面外科、乳腺外科、妇科（妇科肿瘤）、肿瘤化疗专科、肿瘤放射治疗科、结直肠肿瘤专科、神经肿瘤外科、骨科、中西医结合科、病理科、医学影像科、消化内科、麻醉科等15个省级肿瘤临床重点专科群，诊断技术先进、治疗手段完善的肿瘤预防、肿瘤筛查、肿瘤疾病诊疗专科体系，优质护理示范病房达到100％。近五年科研获奖总数为25项，省级奖励共8项，其中特等奖2项、一等奖1项、二等奖3项、三等奖2项；厅级奖项共17项。收治患者80％以上来自昆明以外地区和国家，大量收治了贵州、四川、广西、西藏等周边省份和自治区患者，越南、缅甸、老挝等国家患者也前来就诊。
医院于2018年挂牌成立云南省唯一一家以实体医院为基础的互联网医院——云南省肿瘤医院互联网医院，为百姓解决看病难问题。医院是全国肿瘤专科联盟单位，是云南省肿瘤专科联盟理事长单位，至今成员单位达122家，与多所三级医院和县级医院建立了远程医疗服务协作关系。
医院作为现代医院管理制度试点医院，不断推进治理体系、治理能力现代化建设，综合实力、核心竞争力得到大幅提升，在2022年全国三级公立医院绩效考核肿瘤专科类医院位列第8名，等级A级，CMI值排名全国第四名。通过国家卫健委智慧服务分级评估二级、电子病历系统功能应用水平五级、互联互通标准化成熟度四级甲等、智慧服务三级评审。先后荣获了全国癌症防治先进集体、全国百姓放心示范医院、全国百姓放心百佳示范医院、全国人文爱心医院、中国红十字会公益先锋机构、全国表现突出的省级质控中心、全国卫生健康系统新冠肺炎疫情防控工作先进集体、云南省卫生健康先进集体等荣誉。