新建万年县妇幼保健院位于万年县城建德大街以南锦湖路段，占地30.4亩，新建妇幼保健院分住院部、门诊楼与医技楼，建筑面积20894.7平方米，业务用房面积19633.8平方米。
万年县妇幼保健院编制床位数120张，主要承担全县妇幼保健工作技术指导、婚前医学检查、优生优育健康检查和公共妇幼卫生项目牵头实施。根据临床与保健相结合的原则，万年县妇幼保健院开展妇产科、儿科、内科、外科等临床技术服务，是全县危重孕妇急救中心。
万年县妇幼保健院是事业单位，法人代表李道尧，现任万年县妇幼保健院院长，彭丽云任院支部书记。近几年，万年县妇幼保健院在县委、县政府的正确领导下，积极投身打造环鄱阳湖市场导向型经济强县建设，积极开展管理创新、技术创新、服务创新，不断强化公益单位主体责任，加强小综合大专科建设，取得了明显成效，万年县妇幼保健院妇产科、儿科、小儿疝气手术特色明显，下肢静脉曲张腔内激光治疗手术更在全县独树一帜，赢得社会良好反响的。
万年县妇幼保健院主要科室设置为门诊部一楼有妇产科门诊、儿科门诊、内科门诊、疼痛门诊、外科门诊、门诊药房、门诊收费室、医保窗口，一站式服务窗口、孕产妇管理中心窗口；门诊二楼包括儿童保健科门诊、预防接种室、新生儿沐浴室；门诊三楼包括婚姻登记处、婚检科、优生优育检查科、孕妇学校、妇女保健科，出生医学证明科、心电图室；门诊四楼为行政办公室、会议室。医技楼一楼包括放射科、CT室、中西药库；二楼包括检验科、阴道镜室；三楼包括B超室、四维彩超室；四楼包括后勤物资库房、微机房。住院部一楼包括住院部收费室、夜班收费窗口；住院部二楼包括内儿外科病区、护士工作站、医师办公室；三楼包括妇产科一部病区、护士工作站、医师办公室；四楼包括妇产科二部病区、护士工作站；五楼用于老年康复治疗；六楼为产房、无痛分娩室、手术室、麻醉科、无痛人流室。本院现有医务人员110人，技术95％，其中副主任医师5名，中级职职称医师19人，主管护师8人，医疗技师10人，执业药师3人。
二0一六年十二月，原万年县计生服务站并入万年县妇幼保健院，增挂万年县妇幼保健计划生育服务中心，承担全县妇幼保健与计划生育技术服务监督指导工作。万年县妇幼保健院坚持做好全县孕产妇健康检查和健康指导工作，做好避孕药具免费发放，大力推进健康扶贫和家庭医生签约服务，推广计生适宜技术，特别是国家二孩政策全面放开后，万年县妇幼保健院为应对高龄产妇迅速增多，开设高龄产妇门诊，加强孕产妇管理中心建设和在全省率先推广使用《母子健康手册》，全面贯彻“一法两纲”和《健康中国2030规划纲要》，努力打造贯穿生命全周期全方位的保健服务。