南京市胸科医院，又名东南大学医学院附属南京胸科医院，始建于1950年，是江苏省规模大的胸部专科医院，南京呼吸病及影像临床医学中心、南京肺灌洗中心，承担着省、市胸部疾病的医疗、教学、科研任务。
医院胸外科、呼吸内科、心血管内科、药学部、检验科、重症医学科为南京市医学重点专科。还设有麻醉科、放疗科、中西医结合科、急救中心、内镜中心等临床科室以及医学影像科、病理科、心导管室、气管镜室等医技科室；另有中心实验室、胸心外科研究室、胸部肿瘤研究室等。医院技术力量雄厚，在胸部疾病的诊断、治疗等方面，具有较高的专科水平。