南京市雨花医院为综合性二级医疗机构。是江苏省机关公费医疗定点医疗机构、南京市职工医保定点医院、南京市城镇居民医保定点医院、南京市雨花台区合作医疗定点医院.医院门诊设有内科、外科、妇科、儿科、计划生育、眼科、康复科、口腔科等科室；病区设内科、外科及与江苏省人民医院合作的神经内科二病区。作为区医疗技术的核心力量，医院还设有区急诊中心、区体检中心、区检验中心。神经内科、骨科、康复科是医院重点发展的三大科室，而中医科室的发展是医院的一大特色。作为技术支持，医院的医技科室有检验、b超、心电、放射，同时拥有16排双螺旋ct、drx光机、全自动生化分析仪、彩超、电子胃镜等检查设备。