延吉市疾病预防控制中心位于延吉市局子街3505号，前身是1958年7月成立的延吉市卫生防疫站。2001年2月延吉市卫生防疫站分别成立延吉市疾病预防控制中心及延吉市卫生局卫生监督所。2007年5月26日延吉市疾病预防控制中心与延吉市卫生局卫生监督所合并对外称延吉市疾病预防控制中心，加挂延吉市卫生局卫生监督所牌子，是公益类事业单位。延吉市疾病预防控制中心是我市疾病预防控制技术指导中心及卫生监督机构，是贯彻“预防为主”方针，以预防医学理论及技术进行监测、科研、培训、宣传、指导及卫生监督为一体的，为市政府制定疾病预防与控制规划、方案和措施，提供科学依据和办法的专业技术中心。

延吉市疾病预防控制中心设有17个业务科室，3个职能科室。中心现有编制92个，在编在岗76人，其中高级职称14人（正高5名，副高9名），中级职称31人。

延吉市疾病预防控制中心主要承担着我市65万人口的卫生学及流行病学监测，传染病、寄生虫病、地方病、非传染性疾病等预防与控制；突发公共卫生事件和灾害疫情应急处置；疫情及健康相关因素信息管理，开展疾病监测，收集、报告、分析和评价疾病与健康危害因素等公共卫生信息；负责实施全市免疫预防接种规划及预防用生物制品的使用和管理；开展食源性、职业性、放射性、环境性等疾病的监测评价和流行病学调查，开展公众健康和营养状况调查与评价，提出干预策略与措施；健康教育与健康促进，对公众进行健康指导和不良健康行为干预；疾病预防控制技术管理与应用研究指导等。

延吉市疾病预防控制中心通过了多项国家级、省级项目检测，包括空气污染对人群健康影响监测项目、心血管病高危人群早期筛查与综合干预项目、中西部儿童口腔疾病综合干预项目、国家肿瘤登记项目、全国慢性非传染性疾病综合防控示范区项目、艾滋病综合防控示范区项目、全民健康生活行动项目、健康促进县建设等项目。中心已成为延边大学医学院预防医学专业实习基地，承担着专业实习指导任务。

延吉市疾病预防控制中心与时俱进，拥有生物安全柜、高压蒸气灭菌器、酶标仪、菌落计数仪、电感耦合等离子体（ICP-MS）、高效液相色谱仪、离子色谱仪、原子荧光分光光度计、原子吸收分光光度计、气相色谱仪、10万分之一天平等先进设备，及时掌握信息动态，为政府部门提供科学依据。面对非典（SARS）、各种甲型流感、各种洪涝灾害等事件，不惧困难、众志成城打下一个又一个无硝烟的硬仗，为保障我市人民卫生安全保驾护航，并获“全国肿瘤登记三等奖”、“全国健步走一等奖”、“吉林省思想政治工作先进单位”、“食源性疾病监测工作先进单位”，“六五”普法依法治理先进单位”等荣誉称号。