陕西中医药大学第二附属医院（西咸新区中心医院）占地面积350亩，编制床位1656张，是国家中医药管理局批准的三级甲等中西医结合医院、全国重点建设中西医结合医院、国家推拿专业区域中医诊疗中心（培育）、中医住院医师规范化培训基地、国家药物临床试验机构、陕西省博士后创新基地、陕西省中医（专科）诊疗中心-心血管、陕西省中医药文化建设示范单位、陕西中医药大学第二临床医学院、临床医学一级学科建设单位。2023年3月获批中西医结合旗舰医院试点项目建设单位。
医院始建于1973年，前身为“陕西省第二纺织医院”，2008年8月整建制划转陕西中医学院。2015年更名为“陕西中医药大学第二附属医院”，同年，被国家级高新技术开发区西咸新区管委会批准为“西咸新区中心医院”。医院先后荣获“国家卫生部爱婴医院”“陕西省卫生行业文明示范单位”“陕西省卫生系统先进集体”等称号。医院拥有秦都院区、西咸院区，涵盖临床科室64个、医技科室8个。
人才兴院，构筑结构合理的人才队伍。医院现有职工2307人，其中医师762人，高级职称176人、硕博士459人。拥有全国中医临床特色技术传承人才1人，“千人计划”1人，全国中药特色技术传承人才 2人，全国中医药创新骨干人才1人。
中西医结合，提升专学科建设水平。医院现有重点专学科建设项目31个，其中国家临床重点专科（中医专业）1个；国家中医药管理局“十二五”重点学科3个、重点专科3个（建设项目1个，培育项目2个）；国家中管局区域中医（专科）诊疗中心培育项目1个；陕西省中医药管理局重点学科2个、重点专科9个。开设名老中医工作室17个，国医大师张学文教授、国家级名老中医殷克敬教授等一批全国著名中医药专家长期坐诊、查房和带教。
科技强院，夯实学术研究实力。医院建立了设施完备的中心实验室及国家药物临床试验机构。获批国家中医心血管病临床医学研究分中心、陕西省中医药真实世界临床研究分中心2个、陕西省专病临床医学研究分中心。3年来，医院共承担各级科研项目155项，其中国家自然科学基金4项；陕西省科技计划18项。获授权专利59项，其中国家发明专利6项。获得省部级科技奖励3项。主编参编著作39部。发表学术论文782篇。
立德树人，履行医学教育职能。医院是国家中医住院医师规范化培训基地。2017年，临床医学专业被列为省级一流专业建设项目，2019年入选教育部“省级一流本科专业建设点”，2020年顺利通过教育部临床医学专业认证。建有教学区及医学模拟中心，总建筑面积约3400平方米，设备总值达2400余万元。培养的临床医学专业学生于2021年荣获西南西北分赛区特等奖及全国总决赛铜奖。医院是省内唯一一所国家中医住培教学门诊试点单位。
“十四五”期间，医院将秉承“为人民服务”的宗旨，坚持“强内涵、显特色、铸品牌”的发展战略，以建设国家中西医协同“旗舰”医院为契机，将医院建设成为国内综合能力过硬，中西医结合优势明显，特色突出，服务水平一流，集医、教、研、健康管理与文化传承为一体的大学附属医院、区域诊疗中心，为“健康陕西”和“健康中国”做出更大贡献。