航空总医院是一家集医教研防于一体的三级综合医院，隶属于世界500强、军工央企——中国航空工业集团有限公司，编制床位1200余张，拥有一个总部、四个社区和十个医务室，专业设置齐全，下设61个科室、28个护理单元，是北京市A类定点医疗机构，设有北京急救中心北苑急救站，是航空工业集团试飞员体检中心。承担着周边100余万居民的医疗保障任务以及集团公司40余万员工的职业病防治、医疗保健工作，并肩负着航空工业大型飞行试验的医疗保障任务。
医院始终坚持“健康中寻价值，差异中谋发展”的发展战略，致力于打造特色学科、重点学科和培育学科三个学科体系。医院建设有航空医学工程中心、航空职业病防治中心、航空医疗保障中心、试飞员体检中心等4个航空医学特色学科，旨在加强航空医疗保障与服务，推进医工结合。
医院拥有口腔医学中心、神经医学中心（含神经内科）、麻醉疼痛与重症医学中心、妇产科4个重点学科，口腔医学中心拥有近100张牙椅，多项技术走在国内医学前沿，口腔无痛微创诊疗、牙种植、牙美学修复等专业业内领先；神经医学中心下辖8个神经外科亚专科，拥有200余张床位，年开展手术近4000例，三、四级手术占比90％以上，是中国医师协会软性神经内镜培训基地，承担国家“十三五”课题研究项目；神经内科是中国微循环学会神经变性病专委会脑积水学组主任委员单位、神经变性病示范会员单位、国家卫健委授予的高级卒中中心、北京市神经病学会诊中心；麻醉疼痛与重症医学中心是中华医学会麻醉学分会疼痛诊疗培训基地，开展多项具有特色的疼痛诊疗技术；妇产科是中华妇科肿瘤疑难会诊中心，在晚期妇科肿瘤治疗方面具有国内领先水平，挑战完成亚洲首例渐冻人剖宫产手术，分娩量长期位居北京市前列。
医院已建设形成一批重点培育学科，包括中医科、心内科、消化内科、呼吸与危重症医学科等。中医科拥有国家级非物质文化遗产代表性传承人罗素兰领衔的“罗有明名家研究室”及“阎小萍名医传承工作站航空总医院分站”等研究室；心内科通过2019年首批胸痛中心认证；消化内科ERCP消化道早癌国内领先；呼吸与危重症医学科建设顺利通过三级达标单位评审考核等。
医院秉持“尚德精术”的院训，以“身心护佑，健康同行”为使命，坚持“以病人为中心，以员工为核心”，高度重视内涵建设，注重可持续发展，参与历次国家重大医疗改革，抗击非典、新冠疫情防控、奥运保障、援沪抗疫、医疗扶贫、海外援助、对口支援，在每一个关键节点，都经受住了考验，交出了优秀答卷。医院在2019年、2021年国家三级公立医院绩效考核中成绩位居A级；在北京市医疗服务能力管理综合评价中连续多年跻身前20强，2021年度位列第18位。医院荣获全国“改革创新医院”荣誉称号，2015-2017年荣获国家卫健委“改善医疗服务”先进单位，护理学在2018、2019年度“中国医院/中国医学院校科技量值”排名中分别位列全国三级医院第34位和37位。2019年医院先后荣获人社部和国资委“中央企业先进集体”、“中国医院质量管理奖（医疗2019）卓越奖”、“最具成长力中国医院创新之星奖”；2020年医院获得国资委党委中央企业抗击新冠肺炎疫情“先进集体”和“优秀基层党组织”荣誉称号。医院多次荣获中华全国总工会“全国五一巾帼标兵岗”、中央企业团工委“青年文明号”等荣誉称号。
医院坚持党的全面领导，突出党建引领，注重党业融合“双提升”，建立健全现代医院管理制度体系，继续以“十四五”规划“三高六型创一流（新 361 工程）”的战略目标为指引，以建设“六”型医院为主要抓手，高度重视患者就医体验，注重医、教、研协同驱动，完善学科建设和人才培养机制，持续推动全面高质量发展，向着具有航空医学特色的医教研防管为一体的大型一流三甲医院迈进，为健康中国贡献力量。