峨山彝族自治县妇幼保健院是由政府举办、不以营利为目的、财政全额拨款的社会公益一类公共卫生事业单位。是全县妇幼保健和计划生育服务技术指导中心，集管理、保健、临床、培训、信息统计、健康教育工作于一体。成立于1953年4月，原称为“峨山县兄弟民族妇幼保健站”，1956年10月经县人民委员会批准改称为“峨山彝族自治县妇幼保健站”，1997年11月撤站建院，更名为“峨山彝族自治县妇幼保健院”，2015年8月，县妇幼保健院与县计划生育服务站机构合并为“峨山彝族自治县妇幼保健计划生育服务中心”，保留“峨山彝族自治县妇幼保健院”牌子，2019年4月，更名为“峨山彝族自治县妇幼保健院”，加挂“峨山彝族自治县计划生育和药具管理中心”牌子。
1990年，省卫生厅授予县妇幼保健站为“文明妇幼保健站”。1998年8月，县妇幼保健院荣获“爱婴医院”称号。2002年11月，卫生部授予县妇幼保健院“一级甲等妇幼保健院”。2011年4月，云南省委、省政府授予峨山县妇幼保健院“云南省新一轮防治艾滋病人民战争先进集体”。2020年4月受到县委、县政府新冠疫情防控“集体嘉奖”，2021年6月被县委授予“先进基层党组织”称号。2022年通过云南省妇幼保健院能力达标评审。
峨山县妇幼保健院于2020年8月18日整体搬迁至新址，新院占地面积3321平方米，总建筑面积4794平方米。
峨山县妇幼保健院核定编制59人，现有编制人员56人，空编3个，编外职工25人。截止2023年10月，全院职工数81人，卫生专业技术人员72人，占全院职工数89％，其中医师37人，护士26人，技师7人，药学人员2人；卫生专业技术人员中，正高级职称2人，副高级6人，中级18人，初级及以下42人，未取得职称4人。
我院设有孕产保健部、儿童保健部、妇女保健计划生育服务部3大业务部，检验科、药剂科、医学影像科3个医技科室，保健科、质控办、医务科、医保科、科教科、护理部、感控办、健康教育科、信息科、党办、院办、人事科、后勤保障科、医学装备科、财务科、物资采购办、投诉办17个行政职能科室，共23个科室。
开展的主要业务有妇女保健、妇科门诊及住院、计划生育服务、盆底康复、妇女心理及营养指导、儿童保健、儿科门诊、儿童心理及营养指导、早期干预、儿童先天性心脏病筛查、小儿推拿、穴位贴敷、灸法、刮痧、中药封包、婚前保健、孕前保健、孕期保健、产前筛查、产后保健、孕期心理及营养指导、孕妇学校、高危孕产妇筛查管理等。
我院将进一步加强内涵建设，保障医疗保健服务安全，持续改进服务质量，提高管理水平和服务效率，为促进妇女儿童健康和提高出生人口素质作出应有的贡献。