中国中医科学院针灸医院是一所历史悠久的专科医院，前身为卫生部所属针灸疗法实验所（含门诊部）成立于1951年。1955年中国中医研究院成立，针灸疗法实验所并入中国中医研究院针灸所（含门诊部）。2005年11月中国中医研究院针灸研究所门诊部更名为中国中医科学院针灸医院。中国中医科学院针灸医院是北京市独具中医特色的涉外医疗机构，为北京市基本医疗保险定点单位，是中医类专科医院，是世界卫生组织传统医学国际针灸培训中心的临床教学基地。
中国中医科学院针灸医院有70多年的中医针灸特色医疗服务历史，曾拥有朱琏、魏如恕、薛崇成、程莘农、郭效宗、李传杰等一批享誉中外的名老中医专家。目前医院拥有国内外较高知名度的中医针灸专业医疗队伍近百人，包括多位全国名老中医药专家、岐黄学者、青年岐黄学者、首都国医名师、东城区名家传承专家、中国中医科学院名医名家传承专家、中国中医科学院中青年名医，组成了老、中、青三代名医团队，在针药结合治疗疑难病、妇科疾病、神经系统疾病、骨伤科疾病以及眼病等方面，疗效显著，专科特色明显，形成了独具特色的针灸中药治疗体系。
医院以针灸为主要治疗手段，下设16个科室，12个临床科室，包括中医科，脑病科，骨伤科，风湿病科、眼科、皮肤病科、特色专科、妇儿科、痛症科、脾胃病科、病区门诊、专家门诊。具有五行针灸、长圆针特色诊疗技术，卵巢早衰、绝经综合征、学习困难、过敏性鼻炎、身心疾病等专病门诊诊疗方向。为广大患者解除病痛，提供了更为广泛和行之有效的办法。