昆明医科大学海源学院于2001年由昆明医科大学联合昆明富达实业集团创办，2004年通过教育部首批审核，确认为独立学院，是云南省唯一一所医药卫生类独立学院。2013年通过省教育厅对独立学院首批教学工作评估；2015年民办本科院校办学水平评估中获A等；2023年在省属民办高校办学情况评估中名列前茅。先后被评为云南省优秀普通高等学校、云南省民办教育示范高校、云南省文明学校、云南省委组织部“两新”组织党建工作示范点、云南省大学生就业工作先进单位等。
学校始终坚持社会主义办学方向，全面贯彻党的教育方针，落实立德树人根本任务，秉承“应对需要，教育为本，彰显特色，追求卓越”的办学理念，扎根边疆，面向基层，服务全国，立足于服务区域经济社会高质量发展，着力于“下得去、用得上、留得住”，培养理论基础扎实、实践能力优良、德智体美劳全面发展的高素质应用型医药卫生人才。
学校高新、杨林两校区办学，设有党政管理机构14个，群团机构3个，党总支11个，教学及辅助机构13个，实验实训机构20个，其中省级实验教学示范中心1个、省级虚拟仿真实验教学中心2个。两校区总占地面积698.21亩；图书馆馆藏图书资源总量122.9695万册；自有非直属附属医院3所（昆明医科大学海源学院附属石林天奇医院、附属昆明同仁医院、附属富民医院）；教学医院3所（昆明市妇幼保健院、禄丰县人民医院、昆明安琪儿妇产科医院）；实践教学基地112个。
学校面向全国31个省市区、直辖市招生，截至2023年10月底，全日制本科在校生1.6万人。设有临床医学、口腔医学、护理学、药学、眼视光学等21个本科专业，涵盖医学、理学、工学、管理学、教育学共5个学科门类，其中医学检验技术专业为争创国内一流备案专业，此外，护理学专业为省级一流专业建设点，临床医学、护理学、药学、口腔医学4个专业为省级特色专业，医学影像技术、康复治疗学、运动康复、公共事业管理4个专业为院级特色专业，形成了以省级特色专业为引领，院级特色专业为支撑的专业建设体系。
建校以来，学校不断改善办学条件，推进治理体系和治理能力现代化，深化教育教学改革，提高人才培养质量，共输送医药卫生人才3万3千余人，毕业生年终就业率平均保持在90％以上，毕业生从事专业相关工作的比例超过90％；在北京协和医学院、中山大学、山东大学、第四军医大学、昆明医科大学和欧美、澳大利亚、新西兰等海内外知名高校攻读硕士学位的海源学子近1000人。学校积极开展对外合作与交流，先后与英国、泰国、马来西亚、新加坡、越南、日本等国家的高校或机构开展校际合作，不断提升办学水平。
学校认真贯彻落实云南省教育和卫生健康事业高质量发展三年行动计划，以及全省高等教育高质量发展专题会议精神，聚焦“六个高质量”，以高质量党建引领高质量发展，力争在新征程上创造出不负时代、不负使命、不负人民的崭新业绩，办好让人民满意的教育。