大理州血吸虫病防治研究所属公益一类全额拨款事业单位。其前身为“云南省人民政府卫生厅血吸虫病防治所”，始建于1953年6月。1970年下放大理州领导，名称为“大理州血吸虫病防治所”。1978年更名为“大理州血吸虫病防治研究所”。1990年4月经云南省卫生厅批准（云卫地发（1990）163号），增挂“云南省血吸虫病防治研究中心”牌子，负责全省血吸虫病防治业务技术指导工作。2002年3月因机构改革，省卫生厅撤销“云南省血吸虫病防治研究中心”牌子，相应业务交由云南省地方病防治所承担。2002年4月，经大理州卫生局批准，在本所成立“大理州寄生虫病防治中心”。大理州血防所的主要职能和业务范围是：一是制定全州血吸虫病防治计划和防治对策，参与制定、组织和实施全州寄生虫病的防治规划。负责全州血吸虫病和寄生虫病防治工作质量控制、业务督导、考核和技术指导、业务技术培训；二是建立血吸虫病和寄生虫病突发事件应急处理运行机制，指导和组织调查处理全州发生的重大疫情等突发事件；三是建立和完善血吸虫病及寄生虫病的疫情监测系统，组织开展流行病学调查与疾病监测，分析、预测和预报疫情动态；四是论证、引进、推广和评价国内外血吸虫病（寄生虫病）先进的防治技术；五是进行血吸虫病（寄生虫病）流行病学调查以及开展应用性科学研究活动；六是向社会提供健康咨询和血吸虫病和寄生虫病的诊治服务；七是完成上级交办的其它工作任务。