中国疾病预防控制中心传染病预防控制所（以下简称传染病所）是中国疾病预防控制中心领导下的国家级细菌性传染病预防控制专业机构。
传染病所，前身为中央人民政府卫生部流行病学研究所。1953年6月，中央人民政府政务院文化教育委员会批准成立了中央人民政府卫生部流行病学研究所（隶属卫生部），主要任务为加强侦察断和防止帝国主义使用细菌武器，同时调查国内烈性传染病，采取预防措施。
1956年更名为北京流行病学研究所。
1957年-1958年，长春鼠疫防治所、大连生物制品研究所立克次体室、原协和医学院流行病科、医学科学院真菌研究室先后调至北京流行病学研究所，并更名为中国医学科学院流行病学微生物学研究所。
1971年，与中国医学科学院病毒研究所、放射所合并为中国医学科学院流行病防治研究所。
1979年中国医学科学院流行病防治研究所经重新调整，划分为中国医学科学院流行病学微生物学研究所和中国医学科学院病毒研究所。
后中国预防医学科学院成立，1986年更名为中国预防医学科学院流行病学微生物学研究所。2002年中国预防医学科学院改名为中国疾病预防控制中心，遂同期更名为中国疾病预防控制中心传染病预防控制所。
主要责任
（一）为拟订有关传染病预防控制的法律、法规、标准、规范、预案及规划、策略等提供科学依据，开展防制策略和措施的研究；
（二）为国家生物安全提供技术支持；
（三）实施法定传染病的检测、疫情信息的收集、处理、分析、上报等；
（四）实施重大传染病暴发流行、不明原因性紧急疫情及突发应急事件的处理；
（五）对省级相关业务单位的传染病预防控制实施技术指导；
（六）开展传染病预防和控制相关的研究及技术更新，推广研究成果；
（七）培训专业技术人员。