上海市胸科医院（暨上海交通大学医学院附属胸科医院），创建于1957年，为我国最早建立的集医疗、教学、科研为一体的，以诊治心、肺、食管、气管、纵隔疾病为主的三级甲等专科医院，被卫生部指定为全国心胸外科进修基地，2004年成为上海市红十字胸科医院。医院先后获得“全国卫生系统先进集体”、“全国无烟单位”、“上海市职业道德建设十佳单位”、“上海市文明单位”八连冠等殊荣。
上海市胸科医院创建于1957年，是新中国第一家以诊治心胸疾病为主的三级甲等专科医院，我国心胸外科四大先驱中的三位：黄家驷教授、兰锡纯教授和顾恺时教授，担任首任院长、副院长。同年即被国家卫生部指定为全国心胸外科进修基地，培养了数以千计的心胸专科医师，造就了“中国心胸专科人才的摇篮”。2004年冠名上海市红十字胸科医院，2005年成为上海交通大学附属胸科医院。
追溯胸科医院前身，曾经历了同仁医院（1866年至1903年）、广仁医院（1903年至1942年）、宏仁医院（1942年至1954年）、上海第二医学院附属宏仁医院（1954年至1957年）等四个阶段。1957年11月2日，上海市卫生局、上海第一医学院、上海第二医学院在原宏仁医院的基础上共建成立了上海市胸科医院。建院以来，医院在心胸领域开创了诸多第一：我国第一架鼓泡式人工心肺机，国内首创塑料无缝人造血管、毛绒型涤纶人造血管，国内第一株人体肺腺癌细胞株，世界首例非血缘供体成人单侧肺叶移植术，国内首例冠脉搭桥并行心脏瓣膜置换术，国内首例达芬奇机器人胸部手术等等。
医院核定床位580张，开放床位1000余张，设有10个临床科室、10个医技科室，病区28个，还建有SICU、CCU、RICU、日间病房、临床研究病房和MDT病房。职工近1500人，其中正副主任医师200余名，博导28名，硕导43名。享受国务院特殊津贴专家35名，拥有一批国家卫健委突出贡献中青年专家、国家优青、上海市领军人才、上海市优秀学科带头人、上海市青年拔尖人才等高级别人才。
医院聚焦胸部肿瘤与心血管疾病两大学科群，掌握国内疾病谱最广、门类最全的心胸疾病诊治技术。年门急诊量逾87万人次，手术量超2万例，三四级手术比例90％以上，居上海市级医院首位，食管、气管、纵隔肿瘤手术量居全国第一，肺部肿瘤手术量居全国第二。医院擅长各类胸部疾病外科治疗以及肺移植手术，微创外科手术技术处于全国先进水平，达芬奇机器人胸部手术量连续多年保持单中心全国第一。在国内最早开展肺癌的早期诊断、多学科综合治疗、靶向治疗及免疫治疗等前沿技术，开展最高难度（四级）呼吸内镜技术，在国内率先开展超声支气管镜、荧光支气管镜、电磁导航支气管镜、海博技术等治疗肺癌，多次牵头制订肺癌诊疗相关临床指南。医院在复杂冠心病的内外科治疗、心肺血管结构异常的介入治疗、心脏起搏技术、心脏瓣膜手术、终末期心力衰竭内外科综合治疗等领域均处于国内领先地位，经导管主动脉瓣置入术、左心耳封堵术等前沿技术达国内一流水平，房颤射频消融手术量多年位居亚太地区前列。
医院拥有国家重点学科（心血管病学），国家临床重点专科（胸外科专业、心血管内科专业、心脏大血管外科专业），国家中医药管理局“十二五”重点专科（中西医结合肿瘤科），上海市临床重点专科（胸外科、呼吸内科），上海市肺部肿瘤临床医学中心（肿瘤科），上海市医学重点学科（胸外科）等重点学科。医院是全国首家国际认证胸痛中心，首批中国胸痛中心，首批中国心衰中心，首批中国房颤中心，上海市首批癌痛示范病房，上海呼吸内镜工程技术研究中心，上海交通大学房颤诊治中心，上海交通大学食管疾病诊治中心。
医院有上海市胸部肿瘤研究所、心肺血管转化研究中心、中心实验室、生物样本库四大科研支撑平台，并建有高新技术转化园区，承担国家863攻关课题、国家科技部重大研发计划、国家自然科学基金重点项目等国家级科研项目，曾获全国科学大会奖、国家发明奖和国家科技进步二等奖等国家级科研奖项。医院拥有独立的临床研究中心，建有肺癌、食管癌、纵隔肿瘤三大专病数据库，开展I期临床试验、器械临床试验、研究者发起的临床研究等，牵头肿瘤临床试验数量在全国名列前茅，多次作为国际牵头单位开展抗肿瘤药物的临床研究，数次作为临床试验牵头单位推动国内外抗肿瘤新药注册上市。
医院是国家卫生部冠脉介入、心律失常、结构性心脏病介入诊疗培训基地，卫生部呼吸内镜培训基地，国家住院医师和专科医师规范化培训基地。建有达芬奇机器人手术临床教学示范中心、腔镜实训中心、心血管急救等具有专科特色的医学模拟中心，获RCS认证及AHA认证。面向全球推出国际临床教育项目，吸引来自意大利、亚美尼亚、马其顿、印度等诸国胸外科医生前来接受规范化临床技能培训，并被亚洲胸腔镜教育委员会授予中国大陆唯一一家示范中心。同时，医院还承担着上海交通大学等多所高校的教学科研和博士后培养任务。
医院坚持公益办院方向，积极履行社会责任，承担上海市乃至国家对口援建任务及突发公共卫生事件、重大事件的医疗卫生保障任务。十多年坚持开展贫困地区先心病患儿慈善救助。医院荣获“全国卫生系统先进集体”、“全国维护妇女儿童权益先进集体”、“全国红十字模范单位”、“全国无烟单位”、“全国巾帼文明岗”等荣誉，多年蝉联“上海市文明单位”。