玉溪市第二人民医院筹建于1995年，1998年10月竣工并投入使用，医院座落在玉溪市红塔区星云路4号，占地面积27，890㎡，建筑面积33，938㎡，绿化面积8，738.2㎡，占31.4％，是一所环境优美、建筑布局合理的花园式现代化医院。现已建设发展为集医疗、教学、科研、康复为一体的三级甲等专科医院，目前医院建成“玉溪市心理咨询与治疗中心”、“玉溪市精神疾病防治中心”、“玉溪市精神卫生医疗质量控制中心”三个市级专业（学术）中心，昆明理工大学附属玉溪医院，云南省住院医师规范化培训基地（精神科）。床位编制550张，实际开放床位772张，设医技临床科室32个，机关职能科室10个，临床医技科室有精神科、神经内科、神经外科、普外科、老年病科、内科、急诊科、中医科、五官科、皮肤泌尿科、妇科、临床心理科、儿少精神科、情绪障碍治疗中心、睡眠障碍治疗中心、功能科、检验科、放射科等科室，其中以精神、神经、心理卫生、老年病为医院特色专科，具有较强的技术优势，是玉溪市内唯一一所专业精神心理卫生医疗机构。现有在职职工418人，拥有卫生专业技术人员361人，其中高、中级卫生技术人员129人。
医院拥有一批国际一流的大型医疗设备和技术先进的治疗仪器：美国原装飞利浦16排螺旋CT机，飞利浦产多功能数字化摄影系统（DR机），美国产原装贝克曼库尔特全自动生化分析仪，美国产原装贝克曼库尔特ACCESSS（R）免疫分析系统；日本光电MEK-8222k五类血细胞分析仪；日本阿洛卡a5数字化多功能彩色多普勒超声诊断仪（彩色B超仪）；日本光电多功能床旁监护系统；美国产心脏急救除颤仪；日本福田12导心电图机（型号FX-5200）；英国牛津动态血压和心电监测系统；丹麦产丹肌电诱发电位仪；精神专科特色设备美国产电痉挛治疗仪（型号Somatics.ins）;德国产DWL脑颅多普勒系统;生物反馈仪;动态血压、动态心电;多参数监护仪（PM-7000）;血凝分析仪;脑循环治疗仪（KJ-3000A）以及世界名牌的手术、麻醉设备和妇科理疗仪器等。2015年医院投资完成了急诊科ICU提档升级改造，提升了急危重患者的抢救条件和处置能力，医院综合医疗业务水平迈上新台阶。
建院以来，在医院历届领导班子的带领下，二院人秉承“守业尽责、创新奉献”的院训，勇于担当、奋发有为不断推进着玉溪市第二人民医院向前迈进。2015年医院顺利通过云南省卫计委专家组对医院创建三级甲等精神病专科医院的现场评审，医院内涵建设进一步强化，内部管理机制不断完善，医疗质量和服务水平进一步提升。医院积极推进信息化建设，实现了医院信息交互业务功能和区域信息平台共享交换，开创了医院数字化、信息化建设新局面。HQMS（医院质量监测系统HospitalQulityMonitoringSystem）通过国家卫计委的量化评估，率先在云南地州级专科医院中达到A级水平。
近年来，医院先后荣获“云南省卫生系统思想政治工作先进集体”、“云南省五四红旗团委”、“第十三批、第十四批云南省文明单位”、玉溪市“执行价格法律法规政策最佳单位”、玉溪市和红塔区“文明单位”、“玉溪市星级园林单位”、玉溪市“社会治安综合治理先进单位”、“中国医师协会杰出精神科医师星火燎原奖”等荣誉。
玉溪市第二人民医院正以朝气蓬勃的崭新风貌，发扬““团结、求实、拼搏、创新、发展”医院精神，围绕“打基础、调结构、抓改革、强素质、促发展”的治院方针，不断提高医疗服务质量，为人民的健康做出新的贡献。