什邡市疾病预防控制中心是二级甲等疾控机构，属全额拨款公益一类事业单位，是川北医学院、成都医学院教学实习基地，是北京市疾病预防控制中心、彭州市疾病预防控制中心友好合作单位。现有在职职工75人，建筑面积6111㎡，拥有检验检测设备300余台件，具备306个参数的检验能力，承担全市疾病预防与控制，突发公共卫生事件应急处置，疫情及健康相关因素信息管理，健康危害因素监测与控制，实验室检测分析与评价，健康教育与健康促进，技术指导与应用研究等七大职能，先后通过国家实验室资质认证、省职业卫生技术服务机构、职业健康检查机构、食品检验机构资质认定，为传染病的早期识别、预防和控制奠定了坚实基础。
疾控中心遵循“预防为主、保障健康”的工作方针，履行“以真诚的服务换取公众健康”的服务宗旨，历经防治SARS、甲流、新冠等重大传染病的考验显示出了公共卫生队伍的坚强战斗力和过硬的专业技术素质，先后获得“四川省公共卫生先进集体”、“四川省艾滋病防治先进单位”、“四川省抗击新冠肺炎疫情先进集体”等荣誉称号。