陆军军医大学第二附属医院，始建于1944年，前身是国民党军政部陆军医院，1950年改编为西南军区总医院，1955年转隶第七军医大学，为第二附属医院，对外称新桥医院。1975年改称第三军医大学第二附属医院，2017年改为陆军军医大学第二附属医院。现址由贺龙、邓小平等老一辈革命家亲自选定。现已建设发展成为一所设备先进、学科齐全、技术力量雄厚，集医疗、教学、科研、卫勤、为军服务等一体的大型综合性现代化教学医院，是国家首批“三级甲等医院”，也是重庆市首批“涉外定点医院”。
医院展开床位3000张，拥有国际化一流的重症监护病床312张和现代化层流净化室53间，医院设有临床和医技科室49个，拥有国家临床重点专科军队建设项目、国家级重点（培育）学科、全军医学研究所等学科荣誉61项。医院是临床医学博士后流动站，拥有博士学位授权点学科22个、硕士学位授权点学科29个、国家住培专业基地25个、专培基地3个，现有教职工近5000人，其中教授、副教授近300人，博（硕）士导师近200名。医院年门（急）诊量300万余人次、年收治病人13万余人次，手术量10万余台次。拥有国际一流的重症监护病床312（208+104）张和现代化层流净化手术室53间；其中百级层流手术室19间、千级层流手术室20间、万级层流手术室14间，杂交手术室1间；拥有包括旋转调强适形放疗系统、PET/CT、640层螺旋CT、达芬奇第二代手术机器人、术中放疗系统等先进医疗设备2000余台件，仪器设备总价值18.05亿元。
医院设有临床和医技科室49个，其中，国家临床重点专科军队建设项目5个（呼吸内科、心血管内科、心血管外科、肿瘤科、口腔科）、国家级重点（培育）学科12个（呼吸内科、心血管内科、心血管外科、骨科、神经外科、泌尿外科、普通外科、肝胆外科、普通胸外科、整形外科、消化内科、眼科），国家中医药管理局重点建设专科1个（中西医结合肾脏病重点建设专科），全军医学研究所4个（呼吸内科、心血管内科、心血管外科、肿瘤科），全军医学专科（病）中心11个（呼吸内科、心血管内科、心血管外科、骨科、神经外科、肿瘤科、肾内科、血液科、口腔、超声科、优生优育中心学科（妇产科、儿科、泌尿外科）），重庆市研究所4个（心血管内科、肿瘤科、呼吸内科、肾内科），重庆市重点实验室6个（心血管内科、呼吸内科、肿瘤科、血液科、肾内科、内分泌科），重庆市临床医学研究中心5个（呼吸内科、消化内科、神经内科、血液科、肾内科），重庆市科普基地1个（心血管内科），重庆市工程中心2个（血液科、医学工程科），专病诊疗中心3个（肺小结节与早期肺癌诊疗中心、先天性心脏病专病临床诊疗中心、冠心病专病临床诊疗中心）。医院是临床医学博士后流动站，有博士学位授权点学科22个、硕士学位授权点学科29个。国家住培专业基地25个、专培基地3个。有7个重庆市质量控制中心（血液内科医疗质量控制中心、肾移植医疗质控中心、心脏大血管外科（含心脏移植）医疗质量控制中心、美容外科医疗质量控制中心、临床输血质量控制中心、护理质量控制中心、医学装备医疗质量控制中心）。
医院年门（急）诊量286万余人次，年收治病人12.5万余人次，手术量8.5万余台次，均居国内三甲医院前列，患者来自包括香港、台湾在内的全国33个省市自治区，其中外诊阜患者就率达31.57％，入出院诊断符合率98.45％，治愈好转率99.7％。医院是国内最早一批组建呼吸内科、胸心外科、肝胆外科、肿瘤科等特色专科，最早一批开展胸心手术，甲状腺手术等特色技术，最早一批实施ARDS、酸碱失衡、肿瘤保器官综合治疗等相关特色项目的医院。急慢性呼吸衰竭、心脏衰竭、肾脏衰竭等重大、疑难、危重疾病救治技术居国内领先水平。年开展心脏介入手术8000余例、心脏外科手术3300余例、脊柱微创手术4300余例、脑血管疾病介入手术3000余例（其中神经内科2000余例，神经外科900余例）、难治性癫痫综合征手术治疗累计4000余例，消化内镜诊疗/手术6.7万余例、血液透析9.8余例，造血干细胞移植累计3200余例，肾移植手术累计开展4100（3700，黄赤兵主任）余例，居国内第一方阵，是重庆市首家开展心脏移植的医疗机构。医院已形成以肺、心、脑、肾、脊柱、血液、胃肠、口腔颌面、皮肤等器官系统疑难疾病及肿瘤、重症创伤救治为特色的强大综合救治实力。成功开展了4对胸腹联体婴儿分离、2例异位心矫治以及双头单体女婴救治，被总后勤部首长称赞为“敢治别人不敢治的病，能治别人治不好的病”的为军为民服务模范医院。
医院拥有国家有突出贡献中青年专家、中国“十大”杰出青年、首届中国医师奖、长江学者特聘教授、全国青年科技奖获得者为代表的优秀拔尖人才群体；现有教职员工4751名，其中，教授、副教授167名，博（硕）士导师161名，博（硕）士学位获得者1200余名。医院承担有9个专业层次的临床教学任务。为首批国家级住院医师规范化培训基地和专科医师规范化培训基地，有住培专业基地25个，专培专业基地3个。先后有44名教员获军队院校育才金奖、银奖，3名教员在全国教学比赛中获特、一等奖，3个团队在陆军“教坛之星”比武竞赛中获奖。近年来获批各类省部级以上纵向课题100余项，年经费近亿元，牵头重点研发计划项目7项，国家杰出青年科学基金3项，国家自然科学基金高显示度项目20项，国家自然科学基金项目253项；获批国家、军队、省部级成果奖励共108项，其中国家科技进步二等奖3项，教育部科技成果一等奖1项，中华医学科技一等奖2项，军队医疗成果一等奖4项，军队科技进步一等奖1项，重庆市自然科学一等奖1项，重庆市科技进步一等奖14项。先后获包括军队教学成果一等奖在内的军队（省部）级以上教学成果23项。内、外科学教研室获评总后优秀教学团队，《内科学及野战内科学》列入国家卫生部“十一五”规划统编教材。获评国家一流本科课程、国家精品课程和国家级精品视频公开课3项。代表大学获全国医学院校大学生临床技能竞赛二等奖、西南西北分区赛特等奖。获全国百篇优秀博士学位论文2篇，军队、重庆市优秀博士论文37篇。成功研制了全国首列卫生列车，研发的具有完全知识产权的骨科手术机器人，入选2010年中国“十大”科技新闻。
经过78年的建设与发展，医院秉承“做一流品质、建国际名院”的办院理念，始终致力于“大器官疾病综合救治能力、医疗应急处置能力、现代化院园文化、宾馆式病房服务、国际化人才培养以及生态化营院”医疗品质的塑造。医院先后参加了抗日战争、抗美援朝、中印边境战争、对越自卫反击战等历次战争的卫勤保障，援利抗埃医疗任务、埃塞俄比亚军援任务、中老“和平列车”、中越两军边境联合义诊、中老“和平列车”医学救援联演、埃塞俄比亚军援任务（第二批）等国家（军事）外交任务，以及抗震救灾、援鄂抗疫、援沪抗疫等重大应急医学救援任务，胸心外科刘欲团教授在对越自卫反击战中荣立一等战功。先后获评“全国拥政爱民模范单位”、全国抗震救灾先进集体、国家基本医疗保险定点单位、医德医风先进单位、全国爱婴医院、全军“药材管理先进单位”、全军绿色营院等称号。