山东中医药大学创建于1958年，1978年被确定为全国重点建设的中医院校，1981年成为山东省重点高校，是教育部本科教学工作水平评估优秀学校、山东省人民政府和国家中医药管理局共建中医药院校、山东省应用基础型人才培养特色名校、山东省省级文明校园、山东省高水平学科和高水平大学。学校在省属高校中拥有国家重点学科最多，首批获得硕士、博士学位授权，首批成为国家“973”项目第一承担单位，硕士点数量位居全国同类院校前列。
学校坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，坚持“两个确立”，做到“两个维护”，紧紧围绕立德树人根本任务，坚持社会主义办学方向，全面贯彻党的教育方针，秉承“厚德怀仁、博学笃行”的校训，坚持“以文化人、厚重基础、注重传承、勇于创新”的办学特色，传承精华、守正创新，为党育人、为国育才，经过六十余年几代人辛勤耕耘和不懈奋斗，培养出十余万中医药和健康服务相关专业人才，综合办学实力和社会影响力显著提升。
学校2007年由济南市历下区主体迁入扁鹊故里——长清，总占地2182亩，建筑面积68万平方米。全日制在校生23000余人，其中本科生18000余人，研究生近5400人。图书馆馆藏图书302.1万册、电子图书78.9余万册、古籍善本近3万册，建成“山东中医药大学古籍数字图书馆”数据库平台向社会公众开放，为山东省古籍重点保护单位。学校设置17个教学机构、5个科研机构、4个教辅机构，有山东中医药大学附属医院、山东中医药大学第二附属医院、山东中医药大学附属眼科医院3所直属附属医院、12所非直属附属医院、31所教学医院。现有16家山东省研究生联合培养基地、17家国家中医住院医师规范化培训基地，1个国家级实验教学示范中心、1个国家级大学生校外实践教育基地。
学校坚持厚重基础、注重特色，努力培养高素质中医药人才。现有35个本科专业，涉及医、理、文、工、管、法、教育等学科门类，27个省级一流本科专业，其中10个国家级一流本科专业，17门国家级一流本科课程。有3个博士学位授权一级学科，9个硕士学位授权一级学科，3个国家重点学科。中医学入选山东省“高峰学科”，中药学、中西医结合入选山东省“优势特色学科”，生物医学工程入选山东省“培育学科”。在2021软科中国最好学科排名中，中医学位列第6，中西医结合位列第5，临床医学、药理学与毒理学进入ESI全球前1％行列。先后荣获全国创新创业典型经验高校50强，第二届全国《黄帝内经》知识大赛总决赛总冠军，第四届、第八届中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛金奖，首届全国大学生中西医临床技能大赛团体特等奖。连续三年蝉联中国大学生服务外包创新创业大赛一等奖。先后涌现出一批荣获“中国青年五四奖章”“全国三好学生”“中国大学生自强之星标兵”“山东大学生十大创业之星”等称号的优秀学生。
学校坚持师德为先、人才引领，打造实力雄厚人才师资队伍。现有博士生导师236人，其中兼职导师85人，硕士生导师1019人，其中兼职导师490名。荣获“国医大师”荣誉称号4人，“全国名中医”5人，“岐黄学者”5人，“青年岐黄学者”6人，全国中医药杰出贡献奖获得者2人，“973”项目首席科学家1人，全国优秀教师8人，全国中医药高等学校教学名师2人，“泰山学者”攀登计划专家2人，“泰山学者”特聘专家11人，“泰山学者”产业领军人才1人，“泰山学者”青年专家19人，省部级有突出贡献的中青年专家25人，享受国务院特殊津贴专家53人，入选“全国高校黄大年式教师团队”2个，连续两届获国家教学成果二等奖，荣获省级以上教学成果奖72项。
学校坚持科技驱动、协同创新，推动科研创新取得丰硕成果。现有中医学、中药学、中西医结合3个博士后科研流动站，1个教育部重点实验室，1个国家中医心血管疾病临床医学研究分中心，3个国家级区域中医诊疗中心，6个国家中医药管理局三级重点实验室，2个国家中医药管理局重点研究室，2个全国学术流派传承工作室，拥有国家中医临床研究基地、国家重大新药创制平台（山东）中药单元平台。有山东省重点实验室、山东省工程技术研究中心等省级科研创新平台34个。“十三五”以来，共承担厅局级以上科研课题1370余项，其中国家级项目176项，2018、2019年连续两年首位获得国家科技进步二等奖，共获得山东省科技进步一等奖6项。建校以来，获国家级和省部级一等奖奖励的科研成果共计35项。
学校坚持科教融合、产教融合，主动融入国家地方重大战略。与济南市签署战略合作协议，建成山东中医药大学科研创新大楼。与济南市、澳门科技大学、南粤集团共建鲁澳中医药产业研究院，打造中药质量研究、中药新药及其系列产品研发领域国际合作中心。与青岛市共建青岛中医药科学院、青岛海洋中药研究院、附属青岛医院，打造中医药领域的高层次人才培养基地、重要的科技研发基地和先进的医疗服务基地。推动产学研协同创新，成立南药研究院、全球首家石墨烯医学研究院。与德州市、泰安市等地方政府，与省药监局、省药学科学院等部门单位，与南京中医药大学、黄冈师范学院等院校，与鲁南制药、东阿阿胶、山东建邦集团等企业签署了系列战略合作协议，学校入选新一轮科技成果转化综合试点单位，努力将教育教学优势、科学研究优势、中医药文化优势、医疗服务优势转化为健康产业创新发展优势。
学校坚持以文化人、以文育人，积极打造特色鲜明文化品牌。充分发挥“齐鲁文化、扁鹊故里、针灸发源地”“三张名片”优势，塑造独具特色的大学文化品格。通过举办尼山世界中医药论坛、中国（长清）扁鹊中医药文化节、扁鹊文化与中医经典传承发展国际论坛、第六届中医科学大会、第七届世界中西医结合大会、首届济南扁鹊论坛，叫响“扁鹊故里”文化品牌。通过承办全国性“泰山论灸”学术会议，广泛推广灸疗适宜技术。举办首届“沂山论健?中医药健康大会”，汇聚共谋中医药高质量发展强大合力。成立全国首家省级中医药文化协同创新中心，并成为山东省高等学校示范协同创新中心。获批省内首家中医药智库，成立儒医文化研究会。新中国成立以来规模最大最系统的中医药古籍整理保护计划项目《中华医藏》学术办公室挂靠本校。注重中医药文化传播，广泛开展“万名中小学生进校园”活动，山东省中医药博物馆获批为全国中医药文化宣传教育基地、山东省中医药文化旅游示范基地、山东省社会科学普及教育基地。
学校坚持开放办学、对外交流，不断推动中医药“走向世界”。与世界上近200所高等教育、医疗科研机构建立合作关系，开展中医药相关交流合作，其中活跃密切的国际伙伴有40余家。学校是世界针联对外交往工作委员会以及世界中联中医外治、脉象、内经、抗病毒等专业委员会的挂靠单位，承担“国家中医药服务出口基地”“中国—波兰中医药中心”“中国—尼泊尔中医药中心”“中医外治国际合作基地”“中西医结合眼视光与近视防控国际合作基地”等国家高层次对外交流平台建设任务。
学校坚持大医精诚、厚德怀仁，不断提高中医药健康服务能力。附属医院是全国示范中医院、国家中医临床研究基地、国家中医药传承创新工程建设单位、国家药物临床试验机构、国家中医药考试工作基地、国家中医疫病防治基地、首批全国中医规培基地、国家中医药传承创新中心、国家高级卒中中心、国家区域医疗中心输出医院。第二附属医院是山东省首家省属中西医结合医院，被确定为全省中医治未病、中医康复质量控制中心，牵头成立山东省中医治未病联盟；推进中西医康复联盟建设，立项中西医结合老年医学综合楼建设项目，获批全国中西医协同“旗舰”医院试点项目建设单位。附属眼科医院先后获批山东省首家三级甲等专科眼科医院、中西医结合眼视光与近视防控国际合作基地、国家级首批临床重点专科、山东省中西医结合眼病防治重点实验室、国家眼耳鼻喉疾病临床医学研究中心山东省分中心、山东省眼视光质量控制中心、山东省临床医学研究中心、山东省发改委工程研究中心、山东省中医药特色专科医院。
学校坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，积极推动学校内涵建设和高质量发展，努力在培养高素质中医药人才、推动中医药文化创造性转化创新性发展、服务“健康中国”和新时代社会主义现代化强省建设征程中展现新气象、实现新作为，奋力谱写国内一流中医药大学建设新篇章。