吉林省中医药科学院创建于1958年，历经60余年的发展与积淀，已形成集中医药科研、临床、教学和社会服务于一体的专门机构。目前已形成红旗院区、自由院区、高新院区及长新院区四位一体的建设格局，总占地面积4.6万平方米，总建筑面积8.6万平方米。吉林省中医药科学院是国家中医药管理局首批全国七所重点中医药研究基地之一、卫生部首批中药临床药理基地、国家保健食品注册检验机构、国家技术转移示范机构、中国中医药文献检索中心长春分中心、全国职工职业道德标兵先进单位，同时也是吉林省首批博士后创业基地、省院共建的吉林省创新医药公共服务平台的依托单位、吉林省现代中药产业创新战略联盟理事长单位。先后获批国家中医药传承创新工程省级中医药科研机构项目建设单位、第二批国家中医临床研究基地项目建设单位、国家区域中医（老年病科）诊疗中心建设单位和国家中医药传承创新中心项目建设单位。
医科院现有专业技术人员663人，其中高级专业技术人员316人，专业技术一级岗位1人，专业技术二级岗位12人，专业技术三级岗位21人。首届全国名中医1人，享受国务院政府特殊津贴22人，卫生部突出贡献中青年专家1人，新世纪百千万人才工程国家级人选2人，全国优秀中医临床人才4人，全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师7人，吉林省政府终身教授1人，省高级专家5人，省突出贡献中青年专业技术人才28人，省拔尖创新人才22人，省市名中医23人，博士生导师8人、硕士生导师67人。现有国家卫健委重点专科1个（老年病科），国家中医药管理局重点学科4个（中药化学、中药药理学、中医老年病学、中医痹病学），重点专科6个（肺病科、老年病科、儿科、风湿病科、康复科、肾病科），吉林省中医药管理局重点学科11个、重点专科20个。
医科院依托传统科研优势，坚定不移地走“学科、专科、专家、专病”的发展道路，目前已形成以国家级名中医王玉、蔡鸿彦主任医师为首的中医肺病科，李立新主任医师为首的中医儿科，项颗、孙莉主任医师为首的中医老年病科、康复科等多个中医特色诊疗团队。同时，主动承担社会责任，助力健康吉林建设，投身乡村振兴，参与大型公益活动，开展系列义诊，各类惠民举措和服务惠及几十万人。疫情防控中，全力实施中医医疗救治，积极保障群众生命安全和身体健康，交出“人民至上、生命至上”的满意答卷。全院致力于满足人民群众不断增长的中医药健康服务需求，各项工作实现传承创新高质量发展。
医科院现有国家发改委中医药健康产品研发与检测国家地方联合工程研究中心等21个国家级科研平台，省政府“吉林省创新医药公共服务平台”等52个省级科研平台。多年来，我院承担国家级项目118项、省部级项目383项。获科技奖励220项，其中国家科技进步奖3项、吉林省科技进步一等奖3项、中华中医药学会一等奖1项、吉林省科技进步二等奖及中华中医药学会奖二等奖71项。获得发明专利71项、临床批件42项、国家新药证书38项。实现成果转化176项，2015年，被国家科技部评为国家技术转移示范机构。
激越华章已百载，医海求真再扬帆。医科院在习近平新时代中国特色社会主义思想指引下，全面贯彻党的二十大精神，按照新时代党的卫生健康和科技创新工作方针，坚持以人民健康为中心，坚持加速度、跨越式、内涵型、高质量发展主基调，深入践行新时期医科院文化价值理念，全方位提升医院服务品质、综合实力和社会声誉，奋力建成人民满意的一流医科院，力争为卫生健康事业作出新的更大贡献。