重庆医科大学附属儿童医院于1956年由上海医学院儿科系迁渝创建，是集医教研为一体的国家三级甲等综合性儿童医院，是国家儿童区域医疗中心、国家一流本科专业建设点、国家临床医学研究中心，国家发改委优质医疗资源输出单位，教育部全国党建工作标杆院系，国家卫生健康委全国公立医院党建示范医院，全国文明单位。
医院现有渝中院区和两江院区两个院区，共有编制床位2480张，开放床位2361张。2024年医院门急诊量372.4万人次，住院量11.6万人次，外埠病人比例近40％。医院现有教职员工3900余名，博士生导师50名，高级职称专家400名、享受政府特殊津贴专家22名。
医院最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授予点、博士后流动站，是首批儿科学国家重点学科、教育部重点实验室、国家级国际科技合作示范基地、国家级继续医学教育基地、国家级教学团队、国家精品课程、国家食品药品监督管理局药物临床试验机构、全国住院医师规范化培训示范基地、国家级儿童早期发展示范基地、国家干细胞临床研究备案机构。2023年度中国医院综合量值STEM报告中，医院排名儿科学全国第二，科技产岀第一。2022年度全国三级公立医院绩效考核，位列全国儿童医院第4位。
医院是中华医学会儿科学分会常委单位、中华医学会小儿外科学分会常委单位、中华预防医学会儿童保健分会副主任委员单位，是《中华儿科杂志》、《中华小儿外科杂志》、《中国实用儿科杂志》、《临床小儿外科杂志》等杂志副总编、副主编单位及国内10余家杂志副总编和编委单位；是国家规划教材《儿科学》第六版主编和第七、八版副主编单位，国家规划教材《小儿外科学》第四版、第五版、第六版主编单位。
医院专业设置齐全，有42个临床和医技科室，有重症医学、小儿呼吸、新生儿、小儿外科、临床护理、心血管内科、肾脏内科、神经内科、普外科、风湿免疫科共10个国家临床重点专科，牵头成立19个专科联盟。改良喉气管重建术治疗儿童双侧声带麻痹处于世界领先水平。罕见病（PID）诊治技术、肝移植技术、肾移植技术、脐带血造血干细胞治疗技术、先天性心脏病介入诊疗技术、介入肺科学技术、儿童癫痫手术、微创外科手术、极低出生体重儿综合救治及HIFU治疗儿童实体肿瘤等技术均达国家一流水平。
医院是全国规模最大的儿科医师培养基地，承担着临床医学本科、硕士、博士、博士后教育及临床进修、医师规范化培训等教学任务。年招收本科、硕士、博士研究生400-500名，进修生及规范化培训人员500-600名。拥有先进、齐备的教学设备和临床技能训练室供学员学习和模拟训练。
医院于2019年正式获批国家临床医学研究中心、是发育与疾病教育部重点实验室，有“儿童代谢与炎症性疾病管理及防控”“感染与免疫罕见病”“儿童神经发育与认知障碍”“结构性出生缺陷与器官修复重建”4个重庆市重点实验室。近三年牵头国家重点研发计划项目3项，承担国家重点研发计划课题7项。
医院积极发挥学科带头作用，高度重视国内外交流与合作。牵头组建西部儿科发展联盟，目前有254家联盟成员单位，覆盖西部13个省、市、自治区。成功获批国家发改委第三批、第五批国家区域医疗中心项目，加快项目医院技术、管理和品牌平移，提高医院品牌影响力。医院是中国医院协会儿童医院管理分会副主任委员、全国医院后勤管理委员会副主任委员、中华护理学会副主任委员单位，是“国家级公共机构能效领跑者”、全国医院后勤管理示范单位，国家互联互通四级甲等医院、重庆市“智慧医院”，医院组织绩效目标管理在全国有一定影响。医院与10多所国外一流大学、科研机构建立了稳定的合作关系，是科技部认定的儿童发育重大疾病国际科技合作基地。
医院主动承担社会责任，参与公益活动，申请到“明天计划”“微笑列车”“重生行动”“肢残儿童矫治计划”“白血病基金”等各种基金项目，并牵头建立“重庆市希望工程--小天使基金”，为缓解贫困疾病儿童看病难做出了积极贡献。援助巴巴多斯、接受巴布亚新几内亚医生来院进修，对口援助“昌都市人民医院”、四川省西昌妇幼保健院；派驻多名青年骨干助力乡村振兴。
医院将按照“医疗立院、人才强院、科教兴院、依法治院、文化建院”的发展理念，以“一切为了儿童健康”为己任，努力为促进中国儿科事业发展做出积极贡献。