常州市疾病预防控制中心是政府举办的从事疾病预防控制工作的专业机构，总部位于常州市新北区泰山路203号，是常州市卫生和计划生育委员会下属的全民、全额拨款事业单位，成立于1953年，2002年1月因职能调整，由原卫生防疫站等单位组建并更为现名。中心承担着全市（辖一市、五区）疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情报告及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与干预、实验室检测分析与评价、健康教育与健康促进、技术管理与应用研究指导等7大类260多项公共卫生职能。
中心人员核定编制168人，另有返聘、短期合同工、物业管理等各类人员近百名。截止2016年年底，在编总人数165人，专业技术人员154人，硕士研究生学历以上人员68人，占专技人员总数的41.2％，高级职称61人，中级职称75人。中心内设机构23个，分别为急性传染病防制所、结核病与慢性传染病防制所、非传染病与学校卫生防制所、消毒与媒介生物防制所、血吸虫寄生虫地方病防制所、性病艾滋病防制所、食源性与环境疾病监测防制所、职业病与辐射防制所、健康教育所、检测检验中心、预防医学门诊部、皮肤病性病门诊部、医学实验室、公共卫生生物样本中心14个业务部门和办公室（应急办）、组织监察科、公共卫生宣传科、人事科教（保卫）科、财务科、业务管理与质量控制办公室、信息与网络管理科、总务科、药品器械科9个职能管理科室。
中心坚持科研创新理念，先后与南京医科大学、苏州大学、东南大学、复旦大学、徐州医科大学等国内知名大学以及国家CDC建立了教学、科研、人才培养等多种合作关系。中心注重国际合作交流，先后与英国、法国、澳大利亚、新西兰等国家公共卫生机构及高校开展国际合作交流项目。　　
中心拥有江苏省“职业病诊断资质、职业卫生技术服务机构资质、建设项目职业危害评价资质”，江苏省“公共场所集中空调通风系统卫生学评价机构技术评估资质”，江苏省“司法鉴定资质”等7项资质证书，是江苏省卫计委认定的健康相关产品检验机构和食品安全风险监测市级中心、江苏省司法厅认定的司法鉴定机构（鉴定业务范围：法医毒物常见毒药物、酒精、金属毒物检验）、江苏省出入境检验检疫局认定的出口企业检测服务服务单位。　　
中心总建筑面积近22200㎡，实验用房面积9300㎡，实验室内建有3个负压生物安全Ⅱ级实验室，建成了包括国家流感监测网络实验室、中国细菌性传染病分子分型监测网络实验室、艾滋病病毒确证实验室、江苏省司法厅司法鉴定所、法国梅里埃病原微生物合作示范实验室、常州市食品安全微生物检测中心、常州市医药卫生检测服务平台等10余个专项实验室。拥有飞行时间生物质谱仪、二代基因测序仪、多重致病菌核酸检测系统、全自动病毒载量检测系统、流式细胞仪、全自动细菌鉴定及药敏分析系统、全自动微生物定量检测系统、基因分型指纹图谱分析系统、全自动耐多药结核检测仪、基因探针检测系统、全自动革兰氏染色仪、全自动平板接种仪、液相色谱-离子肼-飞行时间质谱联用仪、在线GPC-GC-MS系统、GC-MS-MS系统、等离子体质谱仪等一批高精尖设备，仪器设备总价达5500多万元，万元以上的仪器设备达300余台，从2003年获得“实验室国家认可”标志以来，目前通过实验室国家认可、实验室资质认定和食品检验机构资质认定的能力共8大类891项，所出具的检测报告在全球90多个国家和地区获得认可。　　
中心作为常州市公共卫生核心专业机构和卫生防病技术指导中心，本着“科学防病、追求卓越”的疾控精神，把“筑疾病预防长城、做大众健康卫士”作为共同愿景，瞄准现代化疾控中心建设的发展目标，全体干部职工勤勉履职，开拓进取，先后获得全国职业病防治、全国计划免疫工作、全国结核病防治、全国消灭脊髓灰质炎工作、全国乙肝疫苗接种工作、全国“十二五”地方病防治工作、农工党中央委员会社会服务工作、江苏省农民工工作、江苏省工人先锋号、江苏省五四红旗团支部等国家级、省级以上先进集体，以及江苏省价格诚信单位、市五一劳动奖状、江苏省文明单位、市文明单位标兵、市企业文化建设先进单位等诸多省、市以上荣誉称号。