贵港市港南区疾病预防控制中心成立于2004年4月，2023年6月按照疾控体系改革要求，经港南区委编委同意，整合港南区疾病预防控制中心和港南区卫生计生监督所职责，重新组建贵港市港南区疾病预防控制中心，为港南区疾病预防控制局管理的财政全额拨款副科级公益一类事业单位，加挂港南区卫生监督所牌子。
贵港市港南区疾病预防控制中心（贵港市港南区卫生监督所）内设办公室、财务科、免疫规划科、流行病防制科、艾滋病防治科、公共卫生科、慢性病防制科、检验科、许可审查科、医疗卫生与中医服务监督科、公共场所与生活饮用水卫生监督科、学校卫生与传染病防治监督科、职业卫生与放射卫生监督科等科室，并设置有二级生物实验室。
依法承担主要职责：负责辖区内疫情信息收集与上报、流行病学调查、疫情防控等日常工作，承担公共卫生、医疗卫生等监督执法工作。