惠州市第二人民医院创建于1966年，原为惠阳地区第二人民医院，位于国家5A级旅游景区惠州西湖的菱湖之滨，占地面积3.13万平方米，建筑面积2.37万平方米。是以精神、心理为主业，集医疗、科研、教学、预防、康复于一体的三级精神病专科医院。是广东医科大学、广州中医药大学实习医院。现有在职员工590人（高级职称54人，中级职称80人），编制床位810张，实际开放床位1100张，10万元以上医疗设备58台（套），可满足我市各类精神、心理障碍患者诊断治疗及普通人群心理健康体检、心理咨询、心理治疗、心理康复等服务。2020年2月加挂惠州市精神卫生中心，主要负责精神卫生预防、诊疗、康复、宣传科普，统筹开展精神卫生流行病学监测、应急医疗处置、信息管理工作，协助有关部门开展精神卫生专业人员培训和业务工作指导。
医院设21个临床科室，分别是精神科（含8个病区）、心身医学科、门诊部、急诊科、医技科、药剂科、心理健康体检与调适科、预防保健科、检验科、物理康复科、放射科、脑功能和心身医学研究所、严重精神障碍患者急性干预科、中医科，其中精神科是市级重点专科、临床心理专业是市级重点培育专科。
医院下属机构惠州市心理卫生研究所，承担心理评估与心理健康体检、心理咨询、心理治疗和心理卫生研究等工作，设有睡眠心理科门诊、临床心理科病区心理健康体检与调适科、儿童保健科、预防保健科等特色专科，满足日益增多的各类心理疾病患者的咨询、治疗、康复、保健需求。
独立法人机构惠州市第二人民医院法医精神病司法鉴定所挂靠本院，依托医院资源独立开展来自惠州、河源、汕尾等市的精神病司法鉴定工作。
医院以“守护心身健康，促进社会和谐”为办院宗旨，以“尊重、关爱、奉献、创新”为院训，以“全面关怀，让患者恢复更好”为服务理念，坚持“质量立院，人才兴院”的基本思路，持续提高医院心理健康服务能力和精神卫生工作水平，不断满足人民群众对心理健康服务的需求，积极创建三级甲等医院。