郓城县人民医院始建于1949年，是一所集医疗、教学、科研为一体的二级甲等综合性医院，是国家爱婴医院、山东省文明单位、山东省立医院医联体医院、山东大学齐鲁医院分级诊疗医院、山东省肿瘤医院肿瘤规范化诊疗基地、滨州医学院实践教学基地、菏泽医专临床教学医院。目前编制床位899张，在职职工1457人，卫生技术人员1187人，其中高级职称131人，中级职称564人，研究生及以上学历72人。设有职能、临床、医技科室70余个，其中临床科室23个。医院医疗设备先进，拥用大型双源CT、西门子3.0MR磁共振、美国瓦里安高能直线加速器、西门子平板大型C臂、DR（计算机X线摄影系统）、进口彩色多普勒、进口全自动生化分析仪、各种进口内镜等大型现代化医疗设备60余台。
2018年医院顺利通过了第三周期二级甲等综合医院复审工作，2019年顺利通过三级乙等综合医院评审。2019年国家二级公立医院绩效考核结果为B++，总成绩为山东省二级公立医疗机构第35名，2020年全省44家参照三级管理综合医院住院服务绩效总成绩排名第4名。2022年门诊量62万人次，住院病人3.3万人次，完成手术1.5万人次。
近年来，医院以六大中心及重点专科建设为抓手，促进各学科协同发展，2019年12月胸痛中心通过了“国家标准版胸痛中心”认证。2021年通过山东省“卒中防治中心”认证，是郓城县急危重孕产妇急救中心、危重新生儿救治中心、创伤中心和癌症中心。心血管内科2020年通过“省级（县域）临床重点专科”验收，心血管内科、神经外科、重症医学科、普外科、新生儿科、消化内科、骨科、泌尿外科等8个科室为菏泽市市级临床重点专科，冠心病介入诊疗为“菏泽市临床精品特色专科”。

2019年以来为优化配置医疗资源，完善医疗服务体系，提高医疗资源利用率和医保基金使用绩效，让居民的医疗卫生需求在县域内就能得到满足，积极组建县域医疗共同体，目前医院与程屯镇卫生院、李集镇卫生院、郭屯镇卫生院、杨庄集镇卫生院、陈坡乡卫生院、侯咽集镇卫生院等20家乡镇卫生院建立了“医共体”关系，正在建设互联互通的医学检验、医学影像、心电诊断、病理、消毒供应等资源共享五大中心，为居民提供疾病预防、诊断、治疗、营养、康复、护理、健康管理等一体化、连续性医疗卫生服务。
郓城县人民医院新院区正在建设中，占地面积2.2万余平方米，建筑面积17.9万余平方米，规划床位1400张，车位1000余个，计划于2023年投入使用，新院区建有门诊楼、住院楼、医技楼，科研教学楼等各功能区域彼此连接又相对独立，科室设置、功能布局及设施设备配置等方面均实现跨越式提升。新院区投入使用后医院将开启一院两区新时代，新院区将丰富科室设置，细化完善专业学科，努力建成“总体布局合理、资源配置优化、学科建设领先、医疗技术优良、科研教学配套、医疗服务满意”的集医疗、预防、教学、科研、康复等功能于一体的三级综合医院。