福州市第二总医院妇幼保健院（福州市妇幼保健院）始建于1953年，时名福州市妇幼保健所，1995年更名为福州市妇幼保健院，位于鼓楼区鼓东路23号；2008年1月迁址至鼓楼区六一中路85号，2016年5月加挂“福州市计划生育服务中心”牌子；新院现址位于仓山区福湾路130号（毗邻海峡奥体中心），于2020年顺利竣工并正式投入使用，现已建成一所集保健、医疗、科研为一体的三级妇幼保健机构。
2023年5月，根据市委、市政府集团化办医建设部署，由福州市第二医院牵头，整合福建省福州神经精神病防治院、福州市妇幼保健院组建“福州市第二总医院”，医院在规划建设、医院运营、人才发展、学科提升、收入分配、物资采购、设备共享、分级诊疗、健康服务等9个方面实行总医院统一管理。

医院建筑面积9.9万平方米，编制床位500张，职工394人，现有高级职称专家54人，硕、博士33人。医院积极探索“院区化”管理模式，不断优化人员配置，完善内设机构，形成孕产保健部、儿童保健部、妇女保健部、计划生育技术服务部“四大部”管理架构，6个行政职能科室由总医院垂直管理，4个医技科室深度融合，9个业务科室采用“大科室”模式建设，配备有CT、MRI、百级手术室、DSA手术室、数字胃肠机、LDR分娩、高端实时四维彩超、断层乳腺摄影系统、高清内窥镜系统、PCR实验室、全自动发药系统等先进医疗设备（系统）。

医院以国家医改政策为引领，积极探索医联体长效共建发展机制和分级诊疗体系，以优势学科带动，牵头组建闽江妇幼专科联盟，实现优质医疗资源下沉，积极构建具有“妇幼”特色的医疗协作服务体系。

医院以妇幼健康为中心，保健与临床相结合为特色，努力构建“大专科小综合强保健”的医疗服务模式，秉承一切为了妇女、儿童健康”的办院宗旨，现有两个市级重点专科，是福州市计划生育中心、福州市高危孕产妇管理中心、福建省智慧盆底健康联盟成员单位、福州市儿童牙病防治中心的挂靠单位，医院重视“两个文明”建设，加强职业道德教育，努力提高医疗服务质量，先后荣获“福州市文明单位”“全国维护妇女儿童权益先进集体”称号。