建于1988年，是综合性国家三级甲等中医医院，为广东省中医名院，广州中医药大学非直属附属医院，广州中医药大学第七临床医学院，全国中医住院医师规范化培训主基地，全国百强中医医院（排名32名，位列全国区县级中医医院第1名），国家标准化心脏康复中心，国家级胸痛中心，国家级卒中中心。经过多年建设，目前集团拥有“1总院（宝安区中医院）、2下设医院（针灸医院、燕罗医院）、18家社康中心”，社康中心遍布新安、西乡、福永、松岗、沙井、燕罗等街道，基本形成覆盖全区的中医药服务网络。
医院现有职工1900多名，其中有博士后13名，在站博士后7名，博士61名，硕士374名，高级职称295名，享受国务院特殊津贴专家2名，享受深圳市特殊津贴专家1名，省名中医11名，市、区名中医10名，博士生导师5名，硕士生导师54名。培养造就了尹建平、金远林、宋银枝等省级名中医、业内领军人物;同时，引进中国工程院院士、国医大师石学敏教授团队、深圳市医疗卫生“三名工程”广东省中医院国医大师禤国维教授皮肤研究团队、符文彬教授针灸学团队、刘旭生教授中医慢病管理团队（护理），广州中医药大学刘中秋教授中药制剂开发及转化药学研究团队、北京中医药大学东直门医院商洪才研究员循证中医药团队（心血管病科）、中国中医科学院广安门医院吕文良教授中西医结合肝病诊治专家团队，并建立多个名老中医工作室。
医院设有床位945张，临床科室47个，医技科室11个。其中国家中医临床重点专科1个（康复科），国家中医优势专科建设单位3个（康复科、心血管病科、重症医学科），省中医名科1个（康复科），省高水平临床重点专科1个（康复科），省级中医临床重点专科1个（骨伤科），省级中医重点专科10个，市级中医临床重点、特色专科11个，省级示范社康中心1个（宝文社康），广东省中医全科专业基层实践基地5个。
医院高度重视科教工作。现为国家中医住院医师规范化培训主基地、广州中医药大学第七临床医学院、广州中医药大学研究生培养基地、多家中医药高等院校教学医院，广东省及深圳市博士后创新实践基地，宝安区针灸临床研究中心挂靠单位。作为临床医学院，医院拥有占地面积1500m的基础科学研究公共平台中心实验室，设有专职科研人员10人，包括在站博士后8名等。同时，组建了16个以PI为核心的科研团队，近3年立项各级科研项目277项，国家自然科学基金项目7项，博士后基金2项，省部级科研项目10项，市新冠病毒感染疫情抗疫专项1项，科研经费达2000万余元;2023年度我院立项4项国家自然科学基金项目、1项中国博士后基金项目、4项广东省自然科学基金面上项目、3项深圳市自然科学基金项目，在数量和质量上均实现了历史性突破。拥有占地面积3200m的技能培训中心，提升住培学员临床应对能力及专业技术水平。