复旦大学附属华山医院创建于1907年，前身为中国人自办的中国红十字会总医院暨医学堂，为中国培养了最早一批现代医学人才。如今，复旦大学附属华山医院是国家卫生健康委委属医院、复旦大学附属医院和中国红十字会冠名医院。1992年，医院首批通过国家三级甲等医院评审，是国内最著名、最具国际化特色的医教研中心之一。
华山医院现有浦东、虹桥、北院等多个院区，共有核定床位2092张，拥有临床医技科室40个。医院共有教育部国家重点学科10个，卫生部国家临床重点专科20个，上海市重中之重临床医学中心4个，上海市重中之重临床重点学科1个，上海市高峰学科1个，上海市临床质控中心8个，设有1个WHO研究与培训合作中心，3个卫生部及上海市重点实验室，各类研究所、研究中心20个。在专科声誉排行榜中，医院有6个学科位于全国前三名，10个学科位于前十名。
医院2019年总门急诊量逾380万人次（全国及世界各地患者占一半以上），出院病人近10万人次，手术6万余人次。华山声誉辐射全国，蜚声海外，是上海首家提供涉外医疗服务的单位，现为10国领事馆指定医疗机构，外籍病人来自全球100多个国家和地区，总计超过60万人次。
医院医疗技术力量雄厚，著名专家云集。现有职工近4000余人，医疗专业技术人员占80％以上，其中高级职称专家近600人，拥有院士3名、长江学者7名、国家杰青5名、“973”首席科学家4名、终身教授22名；国家级专业学术委员会主委或副主委近40名，上海市级专业学术委员会主委或副主委60余名。
在完成大量医疗任务的同时，科研工作成绩突出，学科建设百花齐放。2016年，医院获批成为全国最高级别的科研平台——国家老年疾病临床医学研究中心，也是复旦大学第一个国家临床医学研究中心。近五年来，科研硕果累累，2014年、2015年、2017年均获得国家科技进步二等奖，国家自然科学基金400余项，发表论文4000余篇，被SCI收录2300余篇。其中，华山医院手外科团队首创“健侧颈神经移位治疗中枢损伤后上肢偏瘫”，研究成果以originalarticle发表于权威的新英格兰医学杂志（NEJM），影响因子为72.406分。
华山医院作为学校最早的教学医院，目前以培养面向“双一流”的高质量医学人才为重点，每年承担2000余名学生（学员）的教学工作。近五年来，医院获得上海市精品课程2项，市教委本科重点课程2项，荣获市优秀博士学位论文8篇，市优秀硕士学位论文2篇。每年举办各级各类学术论坛与国家级继续医学教育项目100余项，招收学员逾万人，为国家培养了大量的医学人才。
医院注重与国外的学术交流，每年主办一系列国际性的学术会议，并先后派出医教研及管理团队及个人赴美国、英国、法国、澳大利亚、丹麦、日本、香港、台湾等40余个国家和地区访问学习、参会交流。同时，医院助力“一带一路”倡议，推进国际合作，与捷克卫生部、勃罗夫卡医院开展双边合作，并加入“中国-中东欧国家医院合作联盟”。医院还与美国哈佛医学院、麻省总医院、梅奥医学中心、凯特琳医疗集团以及英国剑桥大学、加拿大UBC大学等知名学府建立了友好合作关系，旨在建设成为中国最卓越的临床医学和医学教育培训中心之一。
在打造国际化优质医院的进程中，华山医院的综合实力得到了充分的证明。在进博会、奥运会、世博会、APEC会议、亚信峰会、上海合作组织五国首脑峰会以及美国总统访华等重要外事活动中承担了重要领导的医疗保障任务。医院凭借过硬的医疗实力和多年的保障经验，长期以来在F1、NBA季前赛、国际汽联世界耐力锦标赛、国际滑联短道速滑世界杯、国际田联钻石联赛、花滑世锦赛、上海环球马术冠军赛等国际赛事的医疗保障工作中表现出色，相关国际运动协会皆给予了高度肯定与赞扬。
华山医院自1907年建院起始终秉承红十字精神，为社会各方提供医疗救助与紧急救援。医院分别在汶川抗震救灾（荣获由中共中央、国务院、中央军委颁发的“全国抗震救灾英雄集体”）、菲律宾台风灾后救援、尼泊尔地震救援、非洲埃博拉病毒救治、江苏盐城龙卷风灾区救援等国内外重大灾害期间开展人道主义救援工作。2017年，医院积极响应党和国家的号召，派出医疗队赴巴基斯坦瓜达尔港助力，投入“一带一路”国家战略需求的第一线，彰显红十字公益精神。1965年至今，医院共有38位医务人员与全国各地的医疗工作者一起，远赴索马里、阿尔及利亚、多哥、摩洛哥以及老挝等国家，秉承着国际人道主义救援宗旨，在非常艰苦的条件下，赢得了受援国人民的尊重。
2020年初，新冠疫情暴发，华山医院积极响应国家号召，先后派遣4批273名医护人员赴湖北武汉增援，是全国330多支援鄂医疗队中派遣人员数最多的医院；除了在武汉市金银潭医院、武汉市第三医院支援外，还负责洪山体育场武昌方舱医院的建设，并且整建制接管同济医院光谷院区重症监护室，受到了孙春兰副总理的肯定。医院为上海新冠疫情防控组长所在单位，在疫情防控中的科普工作得到了社会的广泛赞誉。
华山医院15次蝉联“上海市文明单位”称号，2次蝉联“全国文明单位”，并荣获全国先进基层党组织、全国五一劳动奖状、全国精神文明建设先进集体、全国厂务公开民主管理示范单位、全国青年文明号等荣誉称号。对接国家战略和民生关切，始终是华山的责任与使命。医院继与摩洛哥、云南、新疆、西藏等地建立医疗卫生对口支援后，还在国家卫健委的统一部署下，与海口、福建等地合作共建。按照国务院要求，与福建省人民政府共建复旦大学附属华山医院福建医院，以福建医科大学附属第一医院为依托，建设国家区域医疗中心。通过智慧医疗等模式，使优质服务得以内延外展，惠及20余省市、200多家医院。2018年4月，李克强总理亲自来华山考察互联网远程会诊系统，鼓励医院继续积极发展“互联网+医疗”。
医院将继续践行“厚德仁术、创新奉献”的院训，秉承“公益办院，质量立院，科教强院，文化兴院”的办院宗旨，发扬“敢为人先、甘于奉献、大医精诚、追求卓越”的医院精神，沿着公益性方向积极投身新一轮医改，坚持内涵建设与品牌拓展并重，向着国际化优质医院的目标大步奋进。
复旦大学附属华山医院浦东院区（第二冠名：上海国际医院）坐落在上海浦东金桥地区，毗邻碧云国际社区，距浦东国际机场25公里，周边交通发达，多座浦江大桥和数条越江隧道直通中心城区，于2006年4月28日正式开业。
华山医院浦东院区占地近50亩，环境优美，设施完善，除了拥有Cyberknife等国际先进的医疗设备外，DSA、MRI、CT、彩色多普勒等医疗设施也一应俱全。拥有住院床位200余张，监护室床位40张，诊疗科目设有皮肤科、神经外科、神经内科、射波刀治疗中心、普内科、内分泌科、消化科、运动医学科、感染科、心内科、呼吸科、中西医结合科、整形外科、静脉导管护理、妇科、普外科、疼痛科、重症医学科、麻醉科等学科，并开设健康管理中心和名医工作室及国际部等；2010年8月始与和睦家合作开设的国际门诊有：全科、儿科、妇科、内科、耳鼻喉科、泌尿外科、内分泌科、皮肤科、消化科、心理科。
浦东院区作为碧云国际社区的配套医疗机构，很大程度上解决了碧云国际社区及周边外籍人士的就医问题，是一所以特需服务为主的综合性国有公立医院，提供健康管理服务和名医工作室专家预约服务。
复旦大学附属华山医院虹桥院区选址于虹桥国际交通枢纽，出入上海的民航、铁路、轨交、客运均汇聚于此，是连接长三角15座中心城市、55座中等城市和一千多个小城镇的交通要冲。
虹桥院区占地100亩，总建筑面积13万m2，建筑主体由门诊、急诊急救、医技、住院、科研办公五部分组成，拟形成影像检验中心、放化疗中心、手术中心、康复中心、信息中心五大功能区块，配套国际先进的诊疗设备。设总床位数800张。
虹桥院区的建成，不仅将有助于满足周边居民的就医需求、吸引全国乃至世界各地的患者，更可以在公益性方向不变的前提下，将华山医院建设成为亚洲一流的标志性医院，从而彰显部属医院的实力，体现医疗国家队的作用。
复旦大学附属华山医院宝山院区作为上海市政府“5+3+1”医疗服务实事工程，是集医、教、研于一体的三级综合性医院，是上海北部城郊居民的区域性医疗中心。
华山北院坐落于宝山顾村地区，占地98490m2，核定床位600张，编制职工800名。设有内、外、妇、儿、中等临床与医技科室共38个。医院全新配置了MRI、CT、DSA等先进的医疗设备，在医疗质量、学科发展、教学科研、人才队伍建设方面传承母院特色，华山的神经外科、神经内科、皮肤科、感染科等国家教育部重点学科和卫生部临床重点专科均在北院开设，且学科骨干、管理团队均由母院派遣。此外，还引进了资深妇产科团队、加入“复旦儿科医联体”，完善了学科设置与布局。
华山北院作为上海市公立医院改革试点单位，在医院体制机制与管理模式方面进行了多项创新：实行理事会领导下的院长负责制和总会计师派遣制；执行药品“零加成”，实现医药分开；建章立制，以定期耗材点评、推行试剂管理平台等做好成本控制；与母院视频交班，各类质控管理与华山同步进行；移动医疗、护理工作站全面应用；急诊、ICU一体化管理、推进急诊分级分诊制度；通过适当延长门诊医生的接诊时间，以诊间预约、APP掌上医院等方式完善全预约制度等服务流程的改进，进一步提升患者满意度，使郊区百姓在家门口就能享受到优质便捷的医疗服务，大大缓解了上海市西北地区三级医院紧缺的现状，为完善市、区医疗卫生布局做出了贡献。