新疆维吾尔自治区第六人民医院是一所集医疗、教学、科研、预防及公共卫生服务为一体，以“精专科、强综合、重防治、应突发”为特色的三级综合医院，先后获得“全国文明单位”“全国先进基层党组织”“全国抗击新冠肺炎疫情先进集体”等多项殊荣。

医院前身为自治区胸科医院（始建于1958年）、自治区第六人民医院（始建于2002年）。2023年11月，设立自治区第六人民医院，为自治区疾病预防控制局所属事业单位，公益一类，加挂“自治区公共卫生临床救治中心、自治区结核病防治研究所”牌子，机构规格相当县（处）级，经费实行全额预算管理。

医院主要承担自治区新发突发传染病和重大公共卫生事件的临床诊疗、医疗救治、康复康养等工作；结核病、艾滋病、布病、肝病等传统传染病、地方病医疗救治及全疆督导、技术帮扶、质量控制等工作；其他疾病的医疗、教学、科研、预防和公共卫生服务等工作。履行自治区结核病防治临床中心、自治区结核病临床诊疗质量控制中心、自治区结核病临床实验室诊断中心、自治区结核病远程医疗会诊中心、自治区艾滋病临床治疗管理办公室、自治区艾滋病临床治疗中心、自治区艾滋病临床治疗质量控制中心、自治区传染病专科联盟、新疆医院协会传染病管理专业委员会等社会职能。

现有34个临床医技科室，其中呼吸与危重症医学科、重症医学科、感染科、儿科、急诊科、妇产科、中西医结合科、心血管内科、胸外科、骨科、医学影像科、检验科是优势学科，目前有1个国家级重点专科建设项目，5个自治区级重点专科，2个自治区级临床质量控制中心。

现有院区2个，主院区位于新市区喀什东路，具备新发突发重大传染病综合救治能力，平急结合，人员及床位快速转化，具备跨区域重大传染病救治驰援能力、常态化开展重大传染病防治培训和演练、对常见传染病病原学快速甄别检测和哨点监测预警及辐射带动周边与资源整合能力的重大传染病防治基地。胸科院区位于天山区延安路，依托胸科中心，打造国家级胸外科临床重点专科，逐步建立胸痛中心，作为应急状态下的备用院区。