绍兴市疾病预防控制中心成立于1999年6月，前身为始建于1964年的绍兴市卫生防疫站，是实施疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的公益事业单位。主要承担疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情与健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与控制、健康教育与健康促进、实验室检测分析与评价、技术管理与应用研究等七大职能。中心另对外挂牌绍兴市健康教育所、绍兴市性病监测中心、绍兴市心脑血管病防治中心。是浙江省质量技术监督局批准的计量认证单位、涉水产品检测机构和浙江省卫生健康委批准的职业卫生技术服务、职业健康体检、职业病诊断机构。