如皋市中医院建于1975年12月;1995年被评为国家二级甲等中医院;2010年建成南京中医药大学教学医院;2015年晋级三级乙等中医医院，同年成为南京中医药大学非直属附属医院（筹）;2020年再次通过三级乙等中医医院复评;2023年列入公立医院高质量发展省级试点单位。
医院占地面积28178平方米，建筑面积79798平方米，医疗用房65882平方米，固定资产3.94亿元，设备总值1.06亿元，拥有万元以上设备779台（套）。
医院编制床位1000张，开放床位577张，开设病区11个;职工总数672人，其中高级职称153名，中级职称268名，硕士研究生53名。
医院现有全国优秀中医临床人才1名，全国中药特色技术传承人才2名、培养对象3名，全国中医临床特色技术传承骨干人才培训项目培养对象1名，全国中医（西学中）优秀人才研修项目培养对象1名，南通市226高层次人才3名，南通市医学重点人才1名。
医院先后涌现江苏省名中医6名，江苏省名中西医结合专家1名，江苏省农村优秀中医临床人才4名，南通市名中医6名，南通市百名中医师承指导老师5名，如皋市名中医8名，拥有南京中医药大学兼职教师31名。
医院累计完成市级以上科研项目33个，举办国家级继续教育项目2个、省级继续教育项目8个、市级继续教育项目20个，发表学术论文4000余篇。
医院设有临床一级科室20个，临床二级科室12个，医技辅助科室13个，其中全国农村医疗机构中医特色建设专科2个（妇科、针灸科）、江苏省中医重点专科1个（妇科）、江苏省中医重点建设专科2个（肛肠科、心血管科）、江苏省基层医疗机构中医特色建设专科1个（脾胃病科）、南通市中医重点专科8个（脾胃病科、心血管科、肾外科、肛肠科、针灸科、肺病科、脑病科、骨伤科）、南通市中医重点建设专科1个（乳病科）;拥有全国名老中医药专家传承工作室基层工作站2个（刘沈林、李七一），全国基层名老中医药专家传承工作室1个、首都医科大学安贞医院吕树铮教授心脏介入工作站1个。
医院先后荣获江苏省文明单位、江苏省医保定点先进单位、江苏省卫生行风建设先进集体、江苏省爱国卫生先进集体、南通市廉政文化建设示范点、南通市十佳医院、南通市首批无红包医院等荣誉。