医院始建于1967年，先后称贵州省职业病防治院、贵州省中医研究所附属医院、贵州省疾病预防控制中心附属医院等，2012年更名为贵州省第三人民医院（贵州省职业病防治院）。
现为贵州省人民政府举办，贵州省卫生健康委员会主管，集临床医疗、教学、科研、预防保健、职业病防治、化学中毒与核辐射应急救治为一体的三级公立医院。是贵州省化学中毒救治中心、贵州省核辐射救治中心，国家移动突发中毒事件卫生应急处置中心（贵州）承建单位。
医院现有用地62.9亩，已建业务用房40837平方米，在建57791.4平方米。下设17个职能科室，38个临床及医技科室，拥有省级重点专科1个（职业病科），省级重点中医专科1个（骨伤专科），省级医疗质控中心1个（贵州省职业病临床质量控制中心）。现有在岗职工546人，其中正高职称13人、副高职称63人、中级职称140人、初级职称及以下330人；博士研究生1人，硕士研究生24人，本科生320人。