山东省济宁市兖州区口腔医院成立于1992年，是政府举办的、公立卫生事业单位，隶属区卫计局，为进一步深化济宁市兖州区公立医院改革，整合医疗卫生资源，于2017年9月改制，现为政府主导、华勤集团投资，仍保持公立医院的公益性、非营利性、医院专业化管理、独立性运营模式，实行理事会领导下的院长负责制，设东院、西院两院区，是一所集口腔医疗、预防、保健、教学和社区卫生服务为一体的专科医院，是职工基本医疗保险和城镇居民医疗保险定点单位。
医院专业门类齐全，分科精细，设有牙体牙髓科、口腔颌面外科、口腔正畸科、口腔修复科、口腔特诊科、牙周黏膜科、儿童口腔科、老年牙病科、预防保健科、技工室、手术室、口腔种植中心、消毒供应中心等，是山东省牙防中心、滨州医学院、齐鲁医药学院、枣庄职业学院医学院的教学、实习医院。
兖州区口腔医院是山东大学口腔医院技术协作医院，特聘省内外口腔专家、教授来本院坐诊、技术指导、交流并建立了紧密的技术协作关系。
年门诊量8万余人次，现有职工100余人，口腔专业技术人员80余人，高级职称10人，中级职称30人，研究生10人，80％具有本科以上学历。拥有意大利原装的赛特伟邦口腔综合治疗台、国产牙科综合治疗机90台、美国锐柯3DCBCT、芬兰PlamecaPromax3D口腔CT、日本曲面断层X光机、数字网络化口腔牙片机、法国和韩国牙齿种植机、DV200M型示教系统、意大利Mectron超声骨刀、AutoDenty牙骨粉碎机、意大利原装Er:YAG铒激光、德国imes-icoreCAD/CAM、蔡司手术显微镜、日本森田全自动根管治疗机、德国卡瓦热牙胶机、美国烤瓷炉、高频铸造机、激光治疗仪、牙齿冷光美白仪、心电监护仪、超声波洁牙机、笑气镇静镇痛仪、无痛麻醉仪等先进医疗设备。医院设施齐全，设备先进，拥有先进的意大利电脑数控消毒设备、德国Miele清洗消毒机、德国MELAG蒸汽灭菌器、EURONDA高压蒸汽灭菌器、法国抽真空消毒机等，严格消毒，执业医师的规范操作，一次性医疗用品的推广使用，有效地杜绝了交叉感染。能够开展补牙、牙体牙髓病、根尖病治疗、种植牙、拔牙、牙齿美容及脱色、牙列不齐矫治、高中低档的镶牙、口腔颌面手术等，特别是儿童牙病治疗、牙列不齐矫正、种植牙、牙周粘膜病治疗、高档贵金属修复、微创拔牙、颌面手术是本院的特色项目，开展的高新技术项目已达到同级医院先进水平。
山东省济宁市兖州区口腔医院始终坚持医院的公益性质，坚持改革创新，不断提高医疗技术水平和服务质量，注重人才开发培养，科学管理，积极探索新的经营理念和模式，群策群力，团结合作，提升竞争意识，力争将医院建成山东省同级一流的环境优美、功能完善、设施完备、管理规范、技术精湛、服务优质，具有特色的口腔专科医院。
区牙防中心及区牙防办公室设在本院，医院大力开展社区卫生服务，指导建立健全基层牙防组织，完善全区牙防网络，开展全区范围的口腔疾病普查，建立以中小学生为重点的口腔健康档案，医院专业技术人员深入居民家庭，开展社区口腔卫生保健。