杭州市五云山医院成立于1953年，前身是杭州市五云山疗养院，是杭州市唯一的干部保健基地，杭州市财政局机关事业单位体检中标单位。2014年成为杭州市健康管理中心，是目前唯一的健康管理重点学科单位。
医院占地面积50亩，建筑面积1.3万平方米，地处西湖一级风景区，位于九溪西侧、五云山麓、钱塘江畔，是杭州空气负离子含量最高的区域，素有“天然氧吧”之称。医院共配有100间标准房，12间商务套房，设有多功能厅、大中小型会议室4间，可同时容纳200名来宾疗养、住宿、会议和餐饮。1993年经杭州市公安局批准，被列为涉外开放单位，先后接待了来自德国、日本、美国、俄罗斯、新加坡等国家的众多外宾。
医院现有专业技术人员77名，博士及硕士11名，高级专业技术职称23名，专业方向涉及慢性病、中医、营养、运动、心理等多个健康促进服务内容。2014年，和市一医院、市肿瘤医院实行了一体化合作，成为杭州市第一人民医院集团五云山院区。依托市一医院集团的专业资源，发挥双方优势，根据预防为主的原则，积极探索有效的健康管理服务，着力发展健康管理学科。2020年，成为杭州师范大学附属五云山医院。此外，医院被国家中医药局定为“治未病”预防保健服务试点单位之一；被杭州市预防医学会确定为健康管理专业委员会主任单位。