海南省疾病预防控制中心（以下简称省疾控中心）隶属于省卫生健康委（原省卫生计生委），于2002年6月由原海南省卫生防疫站、原海南省结核病防治研究所、原海南省健康教育所和原海南省热带病防治研究所合并而成，2010年8月升格为副厅级事业单位。目前承担全省疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与干预、卫生检验检测与评价及其他公共服务职能，是海南省疾病预防控制工作技术管理与应用研究指导中心。
目前，省疾控中心内设9个处级（其中管理机构4个，业务机构5个），拥有医学重点学科2个。现有编制数261人，在职人员260人，在编职工256人，专业技术人员209人，占在编人员总数的82％，其中高级职称74人，中级职称89人，初级职称46人；本科及以上学历人员211人，占在编人员总数的82.4％，其中博士6人，研究生62人，本科143人。“515人才工程”第三层次人选5人；南海名家青年项目2人；卫生健康行业经济管理后备领军人才1人；高层次人才58人，含拔尖人才9人、其他高层次人才49人。
在省卫生健康委的正确领导下，省疾控中心继续深化疾病预防控制体系建设，提升公共卫生服务能力，在事业发展上凝聚力量，有序推进，让疾控成果惠及民生。一是着力围筑健康屏障，防控传染病毫不松懈。强化监测技术保障，冲在抗击新冠疫情第一线，登革热、手足口病等重点传染病防控有力，艾滋病和结核病控制措施扎实，全省疫情总体平稳；二是把握海南热带特点，积极巩固既往成果。加强输入性疟疾病例的管理，实现消除疟疾。计划免疫成绩位居全国前列，继续保持高水平常规免疫接种率。三是提升技术服务能力，保障公共卫生安全。海南省疾病预防控制中心已获国家实验室认可（CNAS）和检验检测机构资质认定（CMA），具备职业卫生技术服务机构甲级资质，为我省传染病防控、卫生应急、食品安全、饮用水卫生和职业卫生提供了强有力的技术支撑，目前是全省公共卫生领域开展检测项目范围最广的监测机构。四是以项目工作为契机，发挥全省疾控业务龙头作用。继续争取国内外项目支持，拓展科研项目平台，积极推进国家公共卫生重大项目和基本公共卫生服务项目建设，科学指导基层开展传染病与慢病防控、健康教育等各项业务工作，形成多学科齐头并进的健康发展态势。
近年来，省疾控中心秉承“科学、务实、团结、奉献”的精神，积极充当卫生应急及重大活动卫生保障工作的主力军，成功应对输入性疫情、台风救灾防疫等突发公共卫生事件，出色完成博鳌亚洲论坛年会等重大外事活动传染病防控保障任务。同时加强与国内外科研院校和兄弟单位的横向联系，广泛开展人才培养、学术交流和技术研究等领域的合作，为保障全省人民群众健康，推动海南省卫生事业迈步前进做出了积极的贡献。