菏泽市第三人民医院（菏泽市精神卫生中心、菏泽市脑科医院）始建于1971年，是市级精神疾病防治机构。历经近50年的建设与发展，目前已发展成为以治疗脑科、骨科疾病和医学康复为特色的三级甲等医院。

医院占地28亩，建筑面积4万㎡，开放床位700张，现有职工649人，卫生专业技术人员529人，其中高级专业技术人员85人，中级177人、初级267人。2名市级专业技术拔尖人才，2名市医学会分专业委员会主委。医院设有内科、外科、精神科及康复医学科四大系统18个病区和医学检验、影像、心理治疗、功能检测等辅检科室。其中，精神科、神经内科、康复医学科是市级重点学科；神经外科、骨外科是市级重点学科创建科室。

医院拥有飞利浦彩超和1.5T16通道磁共振、64排东芝CT、全自动日立800生化分析仪、DR系统、脑电及视频脑电监测系统、经颅磁刺激仪、心理CT、认知功能治疗仪、72小时动态血糖检测仪、关节镜、椎间孔镜、神经外科显微镜、康复机器人等一大批先进仪器设备。

医院发展定位是走“强专科、小综合”的战略发展路线。医院现院区较小，已经严重制约了医院的发展。市、区两级人民政府正积极筹划预计划拨300亩左右土地用于新院区建设。目前，医院全方位整合人才、设备、环境等软、硬件资源，正大踏步地向着“建设鲁西南一流脑科医院”的宏伟目标迈进。