福建省福州儿童医院于1986年6月1日开诊，是福建省最早成立的集儿童医疗、保健、康复、科研、教学为一体的三级综合性儿童专科医院，是福建医科大学非直属附属医院。医院附设福州市哮喘支气管炎研究所，现为全国住院医师规范化培训儿内科及儿外科基地、全国儿童生长发育专项能力提升项目培训基地、国家级残疾儿童定点康复机构、福建省儿童医疗救治体系福州分中心、福州市儿童医学中心、闽东北儿科医疗联盟和福州儿科医疗联合体牵头单位、福建中医药大学和福建卫生职业技术学院的教学医院，挂靠福建省中西医结合学会新生儿分会、福建省康复医学会儿童康复专业委员会、福建省预防医学会过敏病预防控制专业委员会、福州市医学会儿科分会、小儿外科学分会、罕见病学分会和福州市中西医结合学会儿科学分会等七个专科学会。荣膺全国爱婴医院、全国模范职工之家、全国文明单位培育单位、全国健康促进医院、全国节约型公共机构示范单位、省级文明单位、省诚信医疗示范单位等殊荣。

医院占地34.07亩，建筑面积9.23万m2。床位650张，职工近千人。医院学科齐全，专科特色突出，设备精良，设有临床医技科室43个，有省级重点专科1个（儿内科）、市级重点专科4个（内分泌专科、小儿外科、NICU、脑瘫专科）、市级培强专科1个（儿内科）、市级培育专科1个（耳鼻咽喉科），内分泌遗传代谢专科、小儿哮喘专科、NICU、儿外科、脑瘫专科、呼吸内科、耳鼻咽喉专科、儿童保健科、儿童心理卫生科、康复医学科等一批学科处于省内领先水平，业已成为福州地区儿童就诊的首选目的地之一。
医院始终秉承“艰苦创业 优质服务 一切为了儿童健康”的办院宗旨，遵循“精、诚、仁、创”院训，不断创新管理理念，以学科建设为主线高质量发展，打造“儿科事业平台、儿童健康港湾”，努力建设立足福州、辐射东南沿海的现代化的儿童专科医院。