东南大学附属中大医院始建于1935年，其前身为中央大学医学院附设医院，历经第五军医大学附属医院，解放军84医院及南京铁道医学院附属医院等几个重要历史阶段。历史上名家辈出，戚寿南、姜泗长、张涤生、牟善初、阴毓璋、王士雯、贺林、杨焕明等众多院士和专家学者曾在此校园求学或执教，奠定了丰厚的文化底蕴和笃学重研的传统。经过87年的发展，现已成为集医疗、教学、科研为一体的大型综合性教学医院，是教育部直属的国家“双一流”A类、“985工程”、“211工程”重点建设大学附属医院，也是江苏省首批通过卫生部评审的综合性三级甲等医院。
东南大学附属中大医院现有编制床位2499张（含江北院区）。年门急诊量238万人次，年出院病人10.6万余人次。拥有高级职称人员413人，博士365人，硕士673人，博士生导师、硕士生导师181人次。医院拥有一批国家级突出贡献专家、国家杰出青年基金获得者、江苏省医学领军人才和江苏省医学优秀重点人才等各级人才工程专家和享受政府特殊津贴者，共计120余人次，在全国及省级专业学会中担任要职的专家100余人次。
医院拥有国家临床重点专科：重症医学科、医学影像学；江苏省优势学科：医学技术学；江苏省重点学科：临床医学；江苏省临床医学研究中心：医学影像与介入放射、肾脏病；江苏省专科（病）诊疗中心：重症医学中心、介入放射诊疗中心；江苏省临床医学中心:?医学影像与介入放射诊疗临床医学中心;江苏省医学重点学科:?重症医学、肾脏病学、心血管病学、血液病学；江苏省临床重点专科（27个）：介入放射科、普通外科、心血管内科、骨科、血液内科、急诊医学科、消化内科、肾脏内科、神经内科、内分泌科、麻醉科、肿瘤科、重症医学科、整形外科、病理科、儿科、妇产科、医学影像科、泌尿外科、呼吸内科、老年医学科、药学、超声诊断科、医学检验科、心理精神科、康复医学科、神经外科；博士后科研流动站：临床医学；Ⅰ级学科博士学位授予点：临床医学；13个校级研究所，形成了一个较为合理的学科梯队。
近年来，与东南大学高水平学科交叉、集成，科研创新能力不断提升，取得一批国家级、标志性的科研项目和成果，课题经费、科研成果与高水平论文数量均创历史新高。近五年累计获得各级各类课题600余项。其中主持国家重大科技专项1项，国家重点研发计划项目5项；主持国家自然科学基金重大科研仪器研制项目1项、重点项目4项、杰出青年基金项目1项，国家自然科学基金200余项。累计发表论文2500余篇，其中SCI收录近1200篇。获得省部级以上科技成果奖励14项，其中，国家科技进步二等奖2项（合作1项），教育部高等学校科学研究优秀成果奖4项，江苏省科学技术奖8项（合作2项）。授权专利46项，其中，发明专利17项，实用新型专利28项，外观设计1项。
长期以来，医院不断提升医疗质量，积极应用医疗新技术，转变护理理念，为广大群众提供了优质、高效、便捷的医疗服务。尤其在重症医学、影像诊断、心血管疾病、介入治疗、血液净化、脊柱病变微创治疗、造血干细胞移植、小耳畸形再造、中风治疗、新生儿重症抢救等多方面居国内先进行列，有的达到了国际先进水平。同时在分子影像、卒中后忧郁、器官纤维化、急性肺损伤等机制的基础研究方面形成特色。医院现有万元以上医疗设备3100余台，拥有达芬奇手术机器人、512层CT、PET-CT、3.0TMRI、1.5TMRI、平板DSA、直线加速器、数字化乳腺机、3D腹腔镜等高精尖设备。
医院不断加强国际合作和交流，先后与美、德、英、日、法、比利时、新加坡等医院及医学院建立了友好合作关系，经常性开展学术交流，定期派出学科带头人和学术骨干参加国际学术会议或出国访问进修。近年来，医院先后荣获国家临床教学示范中心、江苏省“文明单位”、南京市“文明单位”、江苏省“文明医院”、全国省级医院思想政治工作先进集体、全国首批“百姓放心示范医院”、卫生部数字化医院试点示范单位等荣誉称号。