西藏自治区藏医院（西藏自治区藏医药研究院），前身为拉萨“门孜康”（藏医星算院），始建于1916年。1959年西藏民主改革后，拉萨“门孜康”与药王山医学利众院合并组建拉萨藏医院，1980年升格为西藏自治区藏医院，是一家集医疗、科研、教学、预防、保健和藏药制剂生产于一体的三级甲等藏医医院。
医院开放床位519张，科室设置齐全，藏医药特色优势突出。国医大师2名，国家中医药管理局名医传承工作室8个，自治区藏医药管理局名医传承工作室2个，国家级非物质文化遗产项目代表性传承人4名，自治区级非物质文化遗产项目代表性传承人9名。高级专业技术人员110名，自治区级学科带头人2人。现有4个国家级重点研究室，3个国家级重点学科，4个国家级重点专科，3个国家级培育专科。
1996年被国家中医药管理局授予全国示范藏医院。2005年被评为三级甲等民族医医院，同年，被中央文明委、国家人事部授于全国精神文明建设先进单位。2006年成立西藏自治区藏医药研究院。2007被确定为第一批国家级重点民族医疗建设单位。2008年被认定为国家药物临床试验机构，胃肠科、内科等6个专科取得临床试验资格。2009年被确定为全国民族医临床研究基地建设单位，2017年正式挂牌“国家中医（藏医）临床研究基地”。2010年获得“全国医药卫生系统先进集体”荣誉称号。2013年被国家中医药管理局确定为“中医药文化宣传教育基地”。2014年被列为全国“中医药传统知识保护单位”，同年被国家中医药管理授予“首届中医药科技推广先进集体”称号。2015年确定为“住院医师规范化培训基地”。2018年，作为主体单位先后成功申报《四部医典》和“藏医药浴法（索瓦日巴）”进入“世界记忆工程亚太地区名录”和“联合国人类非物质文化遗产代表作名录”。2018年获得“西藏自治区民族团结进步模范集体”荣誉称号。
医院始终坚持“特色建院、专科立院、科技兴院、人才强院、文化育院”的发展理念，秉持“传承创新，济世利众”的办院宗旨，弘扬“敬佑生命，救死扶伤，甘于奉献，大爱无疆”的崇高精神，传承精华，守正创新，突出藏医特色，注重医疗质量，坚守为民宗旨，努力建设一流藏医医院。