清溪医院创建于1958年，是一所集医疗、保健、康复、教学科研为一体的非营利性公立二级管理综合医院。是东莞市社会保险定点医疗机构，广东省全科医师培训基地、广东省高等医学院校教学医院、广东省职业健康体检机构，并获得母婴保健执业许可资格。
清溪医院拥有一个总院区，及康复中医大利、三中两个院区，共设临床医技科室23个。全院总占地2.59万平方米，建筑面积4.87万平方米。全院职工900余人，其中，卫生技术人员700余人，人才结构基本合理。总核定床位665张，开放床位520张。
近年来，医院不断加快发展建设步伐，强化医院管理，建立健全各项规章制度;医疗质量、技术及服务持续改进，打造一批专科联盟，与南部战区总医院建设“军民共建”医院;呼吸内科上与中山三院、下与镇社卫中心形成三级联盟;普外科、助孕门诊与中山三院联盟，超声科与广东省临床医学会华南超声医院专科联盟;重点、特色专科建设和人才培养不断进步，科研和教学水平不断提高，与中山大学附属第三医院合作开展医教研提升计划;与赣南卫生健康职业学院联合办学，探索“产教融合、校企合作”的新型人才培养模式;绩效考核体系持续改进，患者满意度不断提高，医院文化和精神文明建设硕果累累，社会影响力日益扩大。先后获评为东莞市文明标兵单位、东莞市文明单位、东莞市文化建设达标医院;药剂科获评东莞市青年文明号、康复中医科获评省青年文明号、妇产科获评省巾帼文明岗等殊荣。
医院设施设备齐全，配备了1.5T磁共振（MR）、进口64排128层螺旋CT机、DR、乳腺钼靶机、全自动生化分析仪、彩色多普勒超声诊断仪、麻醉呼吸机、心脏除颤起搏器、多功能心电监护仪等一大批进口设备以及胸腔镜、腹腔镜、电子胃镜肠镜、钬激光、纤支镜等微创医疗设备。
医院着重发展特色专科和新技术，相继开展了微创治疗胆囊、胆总管、甲状腺、乳腺、肛肠、泌尿系结石及胸外科、妇科、五官科等手术、消化泌尿呼吸系统各种癌症根治术、脊柱前后入路内固定术、全髋关节置换术、断肢（指）再植术、拇指再造术、高血压脑出血及各种颅脑损伤手术以及子宫切除、妇科癌症根治术等手术。外三科（手外科）为市特色专科;呼吸与危重症医学科成功创建国家PCCM规范化建设达标单位;康复中医科秉承传承精华、守正创新之道，处于全市镇街领先水平。
医院秉承“以病人为中心”的服务理念，不断优化服务流程，积极拓展多种方式的预约挂号、专科门诊服务等便民措施，通过加强医院精细化管理，持续提高医疗服务水平及服务质量，为打造本市技术一流、服务一流、群众满意的综合性公立性医院而不懈努力。