南通市通州区中医院，系“二级甲等中医院”、“全国示范中医院”、“江苏省中医院协作医院”、“上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院中医联盟医院”、“扬州大学医学院教学医院”。医院始建于五十年代末，几十年来，在区委区政府、卫生主管部门及社会各界的关心支持下，经过全院干部职工的团结拼搏、艰苦创业，已把医院建设成为一所环境优美、设施先进、功能齐全、融现代医学与传统医学为一体的综合性中医院，医院社会满意度高，品牌文化彰显，凝聚力空前。
1993年9月，医院成功创成南京中医药大学的教学实习基地，1994年创成“二级甲等中医院”，1995年获评为“全国示范中医院”。此后，又先后荣获“国家级爱婴医院”、“江苏省文明医院”、“南通市十佳医院”、“南通市文明单位”、“南通市无红包医院”、“南通市事业单位管理先进集体”等称号。2013年建成“南京中医药大学教学医院”，2019年建成“江苏省中医院协作医院”、“上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院中医联盟医院”。是通州地区医疗、医教、科研和防保的中心之一，承担着通州和周边地区120多万人口的中西医医疗保健任务。
医院现占地34亩，总建筑面积3.66万平方米，其中业务用房14760平方米。医院核定床位500张，实际开放650张。医院设有急诊、内、外、妇、儿、骨伤、针灸、推拿、肛肠、皮肤、眼科、耳鼻咽喉、重症医学、口腔等15个临床一级科室，脾胃病科、骨伤科为省级中医重点专科建设单位，中医骨伤科、心病科、脾胃病科、脑病科、中医儿科、中医外科为南通市重点专科，肾内科和肺病科被列为南通市“十四五”市级中医重点专科建设项目。医院现有职工707人，其中在编职工513人，卫技人员648人，高级职称129人、中级职称194人，硕士研究生42人。有全国基层名老中医1名、江苏省名中医2名、南通市名中医6名、南通市基层名中医4名，有省级专科护士10名、市级专科护士27名。
医院建有“单兆伟全国名中医通州传承工作室”、“吴勉华全国名中医通州传承工作室”、“季光全国基层名老中医药专家传承工作室”、“黄煌经方通州工作站”、“江苏省名老中医药专家朱建华传承工作室通州工作站”、“南京市中医院肛肠科王业皇教授工作站”、“邱祖萍江苏省名中医工作室”等七个省级及以上中医药传承工作室。医院积极发挥中医药特色优势，开展针灸、拔罐、推拿等中医外治项目24项。
医院拥有1.5T核磁共振、64排西门子螺旋CT、GE彩超、双板DR、STORZ外科腔镜系统、奥林巴斯消化内镜、全自动生化分析仪等先进仪器设备，进一步提高了医院的诊疗水平。外科能独立开展腔镜下食道癌、纵隔肿瘤、肺癌、肺结节、胃肠肿瘤、肝胆结石、肝胆肿瘤、肾癌、输尿管结石、膀胱癌、前列腺癌、子宫肿瘤等手术；开展急性颅脑外伤、胸腹复合伤等危重病例抢救工作；常规开展甲状腺结节、甲状腺癌、乳腺结节、乳腺癌等手术；常规开展白内障超声乳化术、鼻咽息肉切除术、髋关节翻修术、胸腰椎骨折微创椎弓钉内固定术、椎体成形术、骨髓炎骨髓泥保肢术，关节镜韧带修补术、经尿道钬激光碎石术、凸面脑肿瘤切除、脑室镜下脑内血肿清除等。内科新开展急性心脑血管梗塞溶栓术、支气管镜活检和内瘘血管再通术等。
一直以来，医院遵循“传承中医、弘扬国粹、大医精诚、惠泽民众”的宗旨，坚持“厚德、精术、求实、创新”的院训，奉行“温馨、规范、优质、高效”的服务准则，以满足广大人民群众不同层次和特点的医疗需求为己任，赢得了社会的广泛好评。
目前，医院新院建设已顺利启动。新院选址于通州金沙湾片区，项目用地124亩，建筑面积18.18万平米，规划设置床位1000张（其中感染病床100张）。预计2026年投入使用，新院建成后，环境优美、设施齐全、流程方便、功能到位、布局合理，为一所现代化区域医疗健康中心。