国家区域医疗中心上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心福建医院（福建省儿童医院）位于福州市晋安区横屿路966号，占地面积233亩，建筑面积22.7万平方米，编制床位1000张，总投资33亿元。2020年12月，福建省儿童医院开诊运营，2021年医院获批“第二批国家区域医疗中心试点项目”。福建省妇幼保健院位于福州市鼓楼区道山路18号，始建于1935年，建筑面积8.97万平方米，编制床位1000张，为全国首家三级甲等妇幼保健院，全国首批爱婴医院。福建省妇幼保健院五四北院区（福建省妇产医院）位于福州市晋安区坂中路568号，建筑面积17.7万平方米，编制床位800张，总投资金额23.24亿元。2021年11月医院正式开诊运营。
医院现有1个国家级人工智能平台（工信部、国家药监局揭榜挂帅项目）、1个国家级重点实验室（国家卫健委非人灵长类重点实验室）、2个省级重点实验室；3个国家级妇幼保健特色专科、4个省级医疗质控中心、12个省临床重点专科、2个高水平临床医学中心、2个临床医学研究中心。11个福建省省级中心、21个国家级省级专业委员会挂靠医院开展工作。