我院始建于1931年7月，前身是毕节市撒拉溪麻风病防治专科医院，负责全市麻风病防治工作。1986年麻风病实行家庭社会隔离治疗后，医院总部从七星关区撒拉溪镇迁至七星关区城区环城北路（撒拉溪住院部留住老、残麻风病人至今），2012年9月市人民政府决定我院选址七星关区草海大道（现址）采取PPP模式按照三级综合医院标准新建。2013年2月更名为毕节市第二人民医院，从专科医院向综合医院转型。新院（现址）2019年6月投入使用，占地面积69.35亩，建筑面积8.4万平方米，编制床位520张，实际开放床位520张。总投资7.4亿元，大型设备投入约1.2亿元，现有职工740人，编制183个，其中编内人员149人，编外人员591人；医师264人，医技86人，护士320人，行政后勤68人。市委编办批复我院内设机构65个，实设53个内设机构（含二级科室），其中：临床科室28个、医技（辅）科室7个、行政职能科室18个。拥有荷兰进口飞利浦3.0TMRI、GE64排128层CT、飞利浦血管造影系统（DSA）等大型医疗检查设备，在毕节市医疗行业位居前列。绿化面积24540.40㎡，绿化率达到53.13％，设有916个停车位。广州市红十字会医院、广州市皮肤病防治所、广州医科大学附属口腔医院对口帮扶我院。2022年7月，我院皮肤科、骨科、呼吸与危重症医学科成功申报市级第五批医学重点学科。呼吸与危重症医学科荣获“国家PCCM规范化建设二级医院优秀单位”。皮肤科、呼吸与危重症医学科获省级重点专科立项。2023年3月，顺利通过三级综合医院认定。