施甸县妇幼保健院始建于1963年2月，1996年1月由所改院，2015年12月由于机构改革施甸县妇幼保健院和施甸县计划生育服务站撤并成立施甸县妇幼保健计划生育服务中心，加挂施甸县妇幼保健院牌子；2019年7月根据中共施甸县委机构编制委员会办公室关于印发《施甸县卫生健康局所属事业单位机构编制方案》的通知（施编委办〔2019〕19号）要求，施甸县妇幼保健计划生育服务中心更名为施甸县妇幼保健院，机构人员编制由49名调整为48名；现医院地址位于城西开发区（甸阳镇沙坝社区王家村）。
施甸县妇幼保健院是集医疗、保健、预防、教学、健康教育和计划生育技术服务为一体的医疗保健服务机构，承担着全县13个乡镇妇幼保健公共卫生、技术指导和业务培训职能，为施甸县医保定点单位。医院现有在职在编39人，有卫生技术人员34人，其中：主任医师1人、副主任医师7人、中级职称10人、初级师及以下职称16人；其他专业技术人员5人；在职编外人员50人。