南通市第一人民医院暨南通大学第二附属医院、上海交通大学医学院附属仁济医院南通医院、南京医科大学教学医院、南通国际友谊医院、南通市红十字医院，是一所集医疗、教学、科研及健康管理于一体的国家三级甲等综合性医院，也是原卫生部国际紧急救援中心网络医院。医院为江苏省博士后创新实践基地，国家级住院医师规范化培训基地、国家级临床药师培训基地、国家药物临床试验基地、国家执业医师资格考试实践技能考试基地、国家级急救教育示范基地和心肺复苏教研基地、中国灾害卫生应急救援南通培训基地。
医院前身为创建于1907年的南通州基督医院，为南通第一所西医院。1951年医院由人民政府接办，1994年医院被评审为三级综合性医院，2008年晋级为三级甲等综合性医院。新院总建筑面积41.42万平方米，核定床位2600张，现开放床位2462张，实际开放床位1982张，现有职工2402人，卫生专技人员2212人，高级职称428人，教授、副教授31人，硕、博士生导师102人，博士86人、硕士696人，硕博士占医师比77.97％。设有48个病区，33个临床专科，21个医技科室，56个专科门诊、80个专病门诊。南通市临床检验中心亦设在该院。拥有PET-CT、Force双源CT、3.0T及1.5T核磁共振、大平板DSA、瓦里安直线加速器、十二指肠镜、小肠镜、超声胃镜等先进医疗设备。
科教兴院，人才强院。医院形成了人体免疫1个省级医学重点学科/实验室（建设），心血管内科、消化内科、骨科、妇科、医学影像与介入放射科、医学检验科、产科、儿科、内分泌科、病理科、心胸血管外科、急诊医学科、呼吸内科、麻醉科、烧伤科（建设）15个省级临床重点专科（含建设）、11个市级临床医学中心（含建设）、17个市级医学重点学科（含建设）、8个市级医学创新团队（含建设）、市级临床重点专科（38个）实现全覆盖，多项技术在本地区乃至全省处于领先水平。中医科被评为国家级示范中医病区。医院把握健康战略发展，建立健康管理中心；开展多学科联合诊疗，通过中国胸痛中心、房颤中心认证，建成江苏省胸痛、创伤、卒中、孕产妇及新生儿危急重症5大救治中心。近年来“中国医院科技量值研究”中，我院11个学科位列百强，其中护理学曾列全国第15名、省内第1名。
近年来，医院医教研转实现突破。开放型科研公共平台——院临床医学研究中心启用升级，成功创建多个市级重点实验室、南通大学研究所，首家科技成果转化基地签约挂牌，专利落地转化实现新突破。平台孕育成果逐步显现。医院课题立项571项，其中获国自然、省自然、重点行业领域人才项目等省部级项目36项、市厅级课题404项，科技部国家重点研发计划及工信部5G项目实现零突破。获省级及以上科技奖励10项，其中国家级协会科技奖励2项，实现零的突破；获市厅新技术引进奖161项，其中江苏省卫健委新技术引进奖27项，市卫健委新技术引进奖134项。国内首个《中国医院创新转化排行榜》发布，我院位居排行榜第19名，在省内设区市医院中位列第一。
医院享受政府特殊津贴专家8人，江苏省有突出贡献中青年专家2人，市级及以上各类人才总数431人次。“十四五”阶段，获评江苏省“333高层次人才培养工程”培养对象13人次，其中第二层次培养对象实现零突破；南通市“226高层次人才培养工程”培养对象36人次；南通市医学重点人才、青年医学人才各33人次。医院现有博士85人，其中江苏省“双创博士”2人，在读博士百余人，医师队伍中具有博士、硕士学位的占医师总数的75.73％。
百年一院，芳华正茂。策应南通创新区城市新中心、科技创新主引擎以及融入苏南对接上海引领区的定位发展，建设南通创新区医学综合体一期工程暨南通市第一人民医院新院项目。新院作为市重点民生工程及重要医疗保障，南通市政府与上海仁济医院签署战略合作协议，双方将力争把新院建设成为省内一流、苏中领先的三级甲等综合医院及长三角地区重要区域医疗中心，成为南通卫生接轨上海的“排头兵”。与此同时，医院汇聚京沪苏三地高精尖医疗资源，建成7大名医工作室，为我市及周边区域、边远地区疑难重症患者提供了多形式优质便民惠民服务平台，健康服务引领力、辐射力与社会影响力显著提升。
医院秉承救死扶伤的人道主义精神，切实履行“人民医院为人民”的社会职责，20世纪80年代以来连续获得全国红十字先进集体、全国卫生系统先进集体、全国改善医疗服务先进单位、全国医管学科人才类精典案例奖、全国巾帼建功先进集体、全国三八红旗集体、江苏省文明单位、全省卫生健康系统先进集体、省委组织部引才用才成效显著单位、全省纪检监察系统先进集体、江苏省健康促进医院优秀单位、省首批平安医院，市文明单位、十佳医院、信得过医院、“无红包医院”创建先进集体等荣誉称号。