丽江市卫生健康委员会贯彻落实党中央、省委和市委关于卫生健康工作的方针政策和决策部署，在履行职责过程中坚持和加强党对卫生健康工作的集中统一领导。
主要职责是:
（一）贯彻执行国家、省、市有关卫生健康事业发展的法律法规和方针政策，组织拟订健康政策，拟订卫生健康事业发展政策措施、规划计划、地方标准并组织实施。统筹规划全市卫生健康资源配置，指导县（区）卫生健康规划的编制和实施。加强卫生健康人才队伍建设。组织实施推进卫生健康基本公共服务均等化、普惠化、便捷化和公共资源向基层延伸等政策措施。
（二）协调推进深化医药卫生体制改革，落实深化医药卫生体制改革重大方针、政策、措施。组织深化公立医院综合改革，推进管办分离，健全现代医院管理制度，制定并组织实施推动卫生健康公共服务提供主体多元化、提供方式多样化的政策措施。
（三）组织落实疾病预防控制规划、免疫规划以及严重危害人民健康公共卫生问题的干预措施。负责卫生应急工作，组织指导突发公共卫生事件的预防控制和各类突发公共事件的医疗卫生救援，按法定程序报告传染病疫情、突发公共卫生事件应急处置等信息。
（四）贯彻落实国家药物政策和国家基本药物制度，开展药品使用监测、临床综合评价和短缺药品预报，组织开展食品安全风险监测评估，宣传贯彻食品安全标准。
（五）负责职责范围内的职业卫生、放射卫生、环境卫生、学校卫生、公共场所卫生、饮用水卫生等公共卫生的监督管理，负责传染病防治监督，健全卫生健康综合监督体系。牵头《烟草控制框架公约》履约工作。
（六）监督实施医疗机构、医疗服务行业管理办法，建立医疗服务评价和监督管理体系。会同有关部门贯彻执行卫生健康专业技术人员资格标准。组织实施医疗服务规范、标准和卫生健康专业技术人员执业规则、服务规范。
（七）负责计划生育管理和服务工作，开展人口监测预警，研究提出人口与家庭发展相关政策建议，完善计划生育政策。
（八）指导县（区）卫生健康工作，指导基层医疗卫生、妇幼健康服务体系和全科医生队伍建设。推进全市卫生健康科技创新发展。
（九）贯彻落实国家、省中医药法律法规、规章政策以及中医药地方性法规。拟订中医院发展总体规划和目标，负责综合管理中医（含中西医结合、民族医，下同）的医疗、教育、科研、文化建设、对外交流合作等工作。负责中医药传承与创新、中医药人才培养。参与拟订中医药产业发展政策。
（十）建立健全艾滋病防治工作机制，加强宣传教育，采取行为干预和关怀救助等措施，综合防治艾滋病。
（十一）推进丽江市大健康产业的发展，统筹实施医养结合、医体融合等健康政策，承担丽江市大健康产业推进组办公室的日常工作。
（十二）负责市干部保健委员会确定保健对象的医疗保健工作，负责重要会议与重大活动的医疗卫生保障工作。
（十三）组织开展卫生健康宣传、健康教育、健康促进活动，承担卫生健康科学普及、新闻和信息发布工作。开展卫生健康舆情监测及应对工作。
（十四）指导丽江市计划生育协会的业务工作。
（十五）理顺人才工作，加强行业、领域人才队伍建设。
（十六）完成市委、市政府交办的其他任务。