赣州市妇幼保健院始建于1956年，是一所集医疗、保健、教学、科研为一体的三级甲等妇幼保健专科医院和国家级爱婴医院。担负着全市妇幼保健业务指导、科研、教学、人才培训的任务。
近年，赣州市妇女儿童医疗中心，赣州市妇女儿童保健中心，省级危重新生儿救治中心，市级危重孕产妇救治中心，赣州市儿科、儿外科、妇产科区域医疗中心，赣州市妇幼保健技术指导中心，赣州市婴幼儿照护服务指导中心，赣州市出生缺陷综合防治管理中心，赣州市儿科质量控制中心，赣州市围产医学质量控制中心，赣州市小儿外科质量控制中心，赣州市生殖医学质量控制中心和赣州市生殖遗传研究所，国家一级癫痫中心，市级产前诊断中心，市级儿童自闭症鉴定中心，市级儿童听力筛查中心，市级新生儿疾病筛查中心，市级新生儿缺陷防治干预中心和胎儿医学部，市级高危儿管理中心，市级妇女盆底功能障碍性疾病防治中心落户赣州市妇幼保健院。
我院作为具有公共卫生性质的防治结合医疗机构，努力为妇女儿童提供妇幼健康服务，并承担了辖区妇幼健康业务技术管理和技术支持工作。医院先后荣获了国家“母婴安全优质服务单位”、国家“改善医疗服务示范医院”、国家“PAC优质服务单位”和国家“先天性结构畸形救助项目优秀定点医疗机构”以及省、市级文明单位等荣誉称号。
医院赣康路院区（新院区）建筑面积13.5万平方米，编制床位990张；章江北院区（生殖院区）建筑面积0.64万平方米，编制床位100张。
截止2023年5月，医院在职职工1095人，卫技人员945人，占职工总数的86.3％，本科以上学历职工798人，硕士及以上学位90人；正高级职称24人，副高级职称154人。拥有市级医学领先学科3个：儿科、产科（围产医学）、生殖与遗传科。省市共建学科10个：儿童呼吸内科、产科、小儿外科、儿童神经内科、小儿内分泌科、小儿肾内科、新生儿外科、麻醉科、新生儿科（遗传代谢病筛查）、优生遗传实验室。其中在辅助生殖方面处于全市领先、省内先进水平。医院为市内唯一一家实现第一、第二、第三代试管婴儿技术全系列的医疗机构，为提高出生人口素质贡献了力量。