文山州中医医院始建于1985年9月，经过37年的建设和发展，现已成为一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复等综合服务能力为一体的三级甲等中医医院，占地面积40亩，总建筑面积40835平方米。是云南中医药大学（非直属）附属文山中医医院、中国中医科学院广安门医院临床研究基地，以及保山中医药高等专科学校、文山州卫生学校等11所大中专院校教学基地。于2020年12月批准成为国家第三批中医住院医师规范化培训基地。
医院先后有享受国务院政府特殊津贴1人，享受云南省政府特殊津贴1人，云南省“高层次人才特殊支持计划”名医专项1人，第七批全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师1人，云南省第二批老中医学术经验继承导师1人、第三批老中医学术经验继承导师1人，云南省基层名中医1人，云南省优秀青年中医8人，云南中医药大学硕士研究生导师3人，云南省高层次中医药培训对象1人，全国西学中骨干人才1人，全国中医临床特色技术传承骨干人才1人，全国中医药创新骨干人才1人，全国中医护理骨干人才4人，云南省优秀医疗卫生人员2人，云南省健康卫士1人，云南省模范优秀医师1人，文山州委联系专家2人，文山州委州政府专家顾问团成员1人，文山州学术和技术带头人1人，文山州名中医2人，文山州科技技术创新人才1人，文山州“兴文人才”1人，文山州“七乡名医”培养对象和“七乡名医”11人，文山州“七乡学者”1人，文山州优秀医疗卫生人员2人。医院先后荣获省级科技进步奖三等奖2项，中国中医药研究促进会科技进步三等奖1项，州级科技进步奖51项（其中，一等奖1项，二等奖8项，三等奖40项，科普创作奖1项，科技普及奖1项），专著4部、合著8部。作为云南中医药大学（非直属）附属医院，承担着医学本科生、护理本科以及专科、中专生等的教学工作，并承担住院医师、专科医师及全科医师规范化培养等多项教学任务。
　　医院设有门诊部、急诊科、痿病科（重症肌无力科）、康复科、肾病科、肺病科、针灸科、推拿科、儿科、妇产科、肛肠科、眼耳鼻喉科、骨伤一科、骨伤二科、外科、重症医学科、麻醉科、口腔科、治未病科、心病科、脑病科、风湿病科、皮肤科等23个临床科室和医学影像科、超声医学科、营养科、制剂科、医学检验科、输血科、病理科、消毒供应室、药学部等9个医技医辅科室。其中，肛肠科为国家“十二五”中医重点专科建设单位和云南省中医重点专科；骨伤科、康复科、肾病科、肛肠科为云南省中医重点专科，痿病科、妇产科、肺病科、针灸科为文山州中医重点专科；康复科为省级区域中医（康复）诊疗中心建设单位；骨伤科、肛肠科为云南省临床医学中心分中心建设单位，心病科、肺病科、脑病科，妇科为云南省中医特色优势专科。
　　我院注重学科建设和技术创新，大力引进和开展新技术、新项目，先后引进腹腔镜、鼻内镜、硬性软性输尿管肾镜、前列腺电切镜、电子胃肠镜、宫腔镜、关节镜、血液净化仪等先进设备，能熟练开展腹腔镜下胆囊切除术、腹腔镜下阑尾切除术，腹腔镜下疝修补术、腹腔镜下直肠癌根治术，腹腔镜下膀胱癌根治术，腹腔镜下前列腺癌根治术、泌尿外科腔内手术、脊柱内镜手术、关节镜手术和鼻咽喉内镜手术。其中康复医学科、泌尿外科、脊柱外科、关节外科、肛肠外科在州内处于领先地位。痿病科对重症肌无力中西结合治疗有独特疗效。针灸科、推拿科开展中医非药物治疗，大力推广中医适宜技术，开展冬病夏治冬病冬防“三伏三九天灸”、“热敏灸”、督脉灸、平衡罐、调泌针法、冲击波治疗、中药结肠透析等中医特色治疗项目共90项。各科室在疾病诊治中充分发挥中医药优势特色，是文山州中医药发展的排头兵。在坚持中医特色兴院的同时，医院大力引进现代化高精尖医疗设备系统，相继配置了磁共振成像系统、医用射线专用检测仪器多功能全数字化X线摄影系统、螺旋CT、数字化X线摄影系统、彩色多普勒超声诊断仪（4台）、全自动生化免疫分析仪、细菌鉴定及药敏分析系统、全自动血培养系统、全自动凝血测试仪、超声切骨磨骨刀、脊柱内窥镜（颈椎）及配套器械、椎间孔手术动力可转弯磨钻、四肢联动康复训练器、多体位医用诊疗床、便携式肌骨超声系统（整机原装进口）、阿基米德运动康复及悬吊系统、呼吸机等，为医院的健康持续发展奠定了良好的基础。
　　医院发展战略是在“十四五”期间，成为本州内中医特色明显，医疗质量、技术、服务、管理、文化等一流的综合性三级甲等中医医院，中长期目标为努力建成一所高标准、高质量、高水平的州内示范引领，省内有一定影响的中医综合性三级甲等医院。坚持“中医为本，中西协同，发展专科，追求卓越”的宗旨，奉行“勤思致远，笃行至善”的院训，坚持中医为主的办院方向，坚持把突出社会效益、维护群众利益、构建和谐医患关系放在第一位，奉献大爱，造福七乡儿女，先后获得“全国医院文化建设先进单位”“云南省卫生系统行业作风先进单位”“云南省中医药先进集体”“云南省三八红旗集体”“文山州卫生健康先进集体”等20余项荣誉称号。