昆明医科大学口腔医学院前身为昆明医学院口腔系，是国内较早培养口腔医学本科生的医学院校之一。昆明医科大学口腔医学院、昆明医科大学附属口腔医院和云南省口腔医院实行“三块牌子一套班子”的管理体制，是云南省口腔医学教学、科研、医疗和预防保健中心。
口腔医学专业为国家级特色专业，口腔临床医学为云南省重点学科，学院从1979年秋正式招收口腔医学专业五年制本科，1986年开始招收硕士研究生，2003年获一级学科硕士学位授权点。2013年通过教育部专业认证，2020年获国家级一流专业。2021年获口腔医学专业一级学科博士学位授权点、专业博士学位授权点。2022年列入云南省一流建设学科支持建设学科中的特色学科，同时入选省级重点支持建设学科。云南省高等学校本科专业综合评价为B级（国内一流），2022年获省级A类专业建设点。2022年7月获批云南省口腔医学国际科技合作基地。
目前，口腔医学院已建成了包含五年制本科生、硕士研究生、博士研究生、留学生及继续教育在内的多层次人才培养体系，形成了具有自身特色的人才培养模式。建院40多年来，学院敦医促学，共为社会培养2000多名毕业生。近五年来，口腔医学专业第一志愿录取率均为100％，招生录取平均分持续超过一本分数线90分，规培生首考通过率超过90％。
目前在院全日制本科生601人、研究生176人、博士生28人，港澳台学生12人，留学生2人。创办至今，共培养各层次、各类毕业生2000余人。近三年毕业生去向落实率超过80％。
作为云南省高水平的口腔医学教学、研究基地，口腔医学院设有牙体牙髓病学、牙周病学、口腔颌面外科学、口腔修复学、口腔种植学、口腔正畸学、口腔影像学、儿童口腔及口腔预防学、口腔基础学、口腔护理学、口腔生物学、口腔医学人文、口腔全科医学13个教研室，1个实验教学示范中心和1个研究所，获批国家级大学生校外实践教学基地。学院于2007年获批云南省高校重点实验室，2020年获批云南省口腔医学重点实验室（培育），2023年通过省科技厅验收。2020年牵头五家州市医院建设云南省口腔疾病临床医学中心，2021年获批云南省口腔疾病临床医学研究中心。
学院每年举办或承办国际国内学术交流会议，与美国、日本、韩国、泰国、越南等国家和地区的牙学院建立了友好合作关系。多年来共选派40余名教师赴美国、加拿大、英国、泰国、日本等国家研修学习。学院于2004年作为发起人之一加入湄公河区域牙科国际协作组织（IDCMR），成为该组织中唯一的中国院校，并于2013年加入“东南亚牙科教育协会”，积极参与国际口腔医学领域的年度学术交流和访学，有力促进了云南与东南亚国家在口腔医学教育、科研项目的互动与文化交流。
昆明医科大学附属口腔医院始建于2006年10月，由昆明医学院第一、第二附属医院口腔科组建而成，2007年加挂云南省口腔医院牌子。医院是云南省口腔医学会、云南省医师协会口腔医师分会、云南省口腔疾病诊疗质量控制中心挂靠单位；是云南省唯一的口腔专科护理人才培养基地，2020年入选国家第三批住院医师规范化培训基地。
作为云南省唯一的三级口腔专科医院，全院有教医护职工601名，具有高级职称的专业技术人员62人，博士研究生导师15人，硕士生导师42人；专业拥有一支结构合理、素质优良的师资队伍。现有教医师230中具有博士学位人员36人、硕士学位人员186人，具有硕士及以上学位的教师占教师总数的97％。医院设有212台牙椅，34张病床，共有14个临床医技科室（牙体牙髓科、牙周病科、口腔颌面外科、口腔修复科、口腔正畸科、儿童口腔科、口腔预防科、口腔种植科、口腔综合科、口腔特诊科、口腔影像科、检验科、消毒中心、手术室），2个特色专科门诊（颞下颌关节专科、口腔黏膜科）、5个直属门诊部（第一门诊部、第二门诊部、呈贡门诊部、前兴路门诊部、五华昆百大门诊部）。多点办医有效扩大服务范围，提升社会服务能力，2022年门诊人次突破45万。
“十三五”期间科研工作成绩斐然，共获科研项目197项（含12项横向课题），其中国家自然科学基金18项，国家社会科学基金1项；获云南省科技进步一等奖1项，二等奖1项，三等奖2项，2019年获奖等次及数量实现建院以来的历史性突破。“十三五”以来，师生发表论文527篇，其中高质量论文158篇（SCI83篇，北大核心75篇），获专利84项，出版专著25部。“十四五”开局良好，近两年新增国家自然科学基金项目9项，新增科研经费1000余万元，获云南省科技进步三等奖2项。
医院持续开展专科联盟和医联体建设，是“国家口腔疾病临床医学研究中心”成员单位，从2008年起先后加入上海交通大学医学院附属第九人民医院牙颌面畸形诊治专科联盟、牙周病诊治专科联盟、牙体牙髓疑难疾病诊治专科联盟、口腔正畸专科联盟、口腔修复专科联盟；与四川大学华西口腔医院、重庆医科大学附属口腔医院签订专科联盟协议，促进医院在西部地区进行口腔疾病临床医学研究及应用推广，为西南口腔患者跨区域联合诊疗、区域转诊搭建高速有效的绿色通道。
我院每年举办或承办国际国内学术交流会议，与美国、日本、韩国、泰国、越南等国家和台湾地区牙学院建立了友好合作关系。先后共选派了40余名教师赴美国、加拿大、英国、泰国、日本等国家研修学习。学院于2004年作为发起人之一加入湄公河区域国际牙科协作组织（IDCMR）成为该组织中唯一的中国院校，并于2006年、2019年主办第三届、第十四届湄公河区域国际牙科协作组织学术年会。2013年加入“东南亚牙科教育协会”。连续十年累计派出200余名师生赴东南亚地区参与域内外口腔医学领域的学术交流和访学，接收多所泰国大学牙学院年轻教师及学生到院进行短期学习，有力促进了云南与东南亚国家和地区在口腔医学教育、科研项目的互动与文化交流。